在我国社会市场经济体制和公共财政体系逐步建立与完善的过程中，针对财政收支问题，财政部门将大部分精力放在了财政收入的管理上，而对财政支出的重视程度不够，导致财政资金在实际使用中效率不高，形成“低效投资”。我国政府倡导以人为本，随着公众对财政资金使用效率的关注程度日益加深，各级政府也逐步在实际工作中积极深化和推进财政支出绩效评价工作，这对创建服务型政府、优化公共资源配置、促进和谐社会建立、加快经济发展方式转型具有重要意义。伴随着我国经济的快速发展，资源耗竭与环境污染问题日益严重，如果没有完善的措施加以处理，将会给经济发展、生态环境和居民健康带来不可估量的深远影响，政府部门投入大量财政资金，众多环境保护项目纷纷落成，以期起到防治污染、改善生态环境、保护公众健康的作用。为了对资金使用效率、项目运行情况以及绩效目标是否达成等进行监督与核实，环境保护项目财政支出绩效评价工作的开展显得不可或缺，而开展该项工作的关键就是指标体系的构建，环境保护项目财政支出不同于其他类型的财政支出，其预期想要收获的不仅仅是经济效益，更是巨大的环境效益和社会效益，如何通过指标的具体设置对其综合绩效进行全面的衡量是准确、客观、公正的评价和衡量环境保护项目财政支出绩效的基础，也为环境保护部门和财政部门有效决策提供了有利支持。在长期的实践工作中，平衡计分卡在企业管理中获得了巨大的成功，在政府绩效评价中也被证明是一种行之有效的方法体系。本文在引入平衡计分卡理论的基础上，结合环境保护项目财政支出绩效评价的特点，将指标体系分为三个层次，分别从财务、公众、内部流程、学习与成长四个维度出发，对环境保护项目财政支出绩效评价指标体系进行构建，并以××污泥生产水泥新技术示范项目为例，运用系统分析和比较分析相结合、理论分析和案例分析相结合的研究方法，结合具体实际案例进行指标设计和绩效评价，对构建的环境保护项目财政支出绩效评价指标体系的有效性和可行性进行了验证，由此得出一套专门针对环境保护项目的全面、合理、可行、可比的绩效评价指标体系。在当前环境保护项目财政支出绩效评价指标体系尚不完善的情况下，将该指标体系应用于环境保护项目的绩效评价将促进环境保护项目财政支出绩效评价理论和实务的发展，具有一定的实用价值和理论意义。