大西洋及南极海域三株细菌的多相分类研究

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本文以分离自大西洋表层海水样品的两株细菌及南极潮间带沉积物的一株细菌为研究对象,利用多相分类方法,详细研究了这三株细菌的表型,细胞化学组成及遗传学等方面的分类特征,最终分别确定了它们分类地位。1.菌株SM1354T的多相分类研究菌株SM1354T采集自大西洋表层海水样品。菌株SM1354T的革兰氏染色反应为阴性,细胞为长杆状,无鞭毛但又滑动能力。其生长温度范围为4-40℃,最适生长温度为30℃;其生长需要NaCl,其生长盐度范围是0.5-11%(w/v),最适盐度为3.0%(w/v)。该菌触酶及氧化酶均为阳性但不能还原硝酸盐。该菌能降解DNA,七叶苷,酪蛋白,弹性蛋白,肽聚糖,明胶,Tween 80,但不降解淀粉。此外,菌株SM1354T能发酵七叶苷,arbutin及potassium5-ketogluconate产酸,并能同化利用葡萄糖、麦芽糖和苹果酸。菌株 SM1354T的主要脂肪酸是 iso-C15:0,iso-C15:1G,iso-C17:03-OH 及 C16:1ω7c。该菌的极性脂包括磷脂酰乙醇胺(phosphatidylethanolamine,PE),三种未鉴定结构脂类,一种未鉴定结构含氨基的脂及一种未鉴定结构的含氨基的磷脂。该菌的主要细胞呼吸醌是甲基萘醌7(menaquinone-7,MK-7)。菌株SM1354T的细胞基因组DNAG+C含量为33.9 mol%。菌株 SM1354T与Marivirga属16S rRNA 序列相似度最高(96.0~96.2%),基于16S rRNA基因序列的系统进化树显示菌株SM1354T与 Marivirga tractuosa及Marivirga ·sericea成簇,形成单独的进化分支。基于以上多相分类学数据,菌株SM1354T代表Marivirga属的一个新种,命名为 Marivirga atlanticaa sp.nov.,菌株 SM1354T(=CCTCC AB 2014242T = JCM 30305T)为该种的模式菌株。2.菌株SM1351T的多相分类研究菌株SM1351T分离自大西洋海域的表层海水样品。菌株SM1351T细胞呈短杆状并以单极生鞭毛运动。菌株SM1351T生长温度范围在4-45℃之间,其最适生长温度为35℃;其生长盐浓度范围为0.5-9.0%(w/v),最适盐浓度为3.0%。该菌是严格好氧的革兰氏阴性菌,其触酶及氧化酶均为阳性。菌株SM1351T不能还原硝酸盐,且不能够水解DNA,七叶苷,酪蛋白,弹性蛋白,明胶,Tween 80;但是该菌能水解酪氨酸,Tween 20,Tween40,Tween60。菌株SM1351T的主要脂肪酸包含C16:ω7c,C17:1ω8c,C18:1ω7c,C16:0及C14:0;其极性脂包括磷脂酰乙醇胺(phosphatidylethanolamine,PE)、磷脂酰甘油(phosphatidylglycerol,PG)、二磷脂酰甘油(diphosphatidylglycerol,DPG)、三种未鉴定结构的氨基磷脂及三种未鉴定结构的极性脂类。菌株SM1351T的主要呼吸醌类为泛醌8(ubiquinone8,Q8)。菌株SM1351T基因组DNAG+C含量为 62 mol%。菌株SM1351T与Haliea salexigens的16S rRNA基因序列相似度最高(96.2%)。基于16S rRNA基因序列的系统进化树显示菌株SM1351T与Haliea salexigens形成单独的进化分支。以上多相分类数据表明,菌株SM1351T代表Haliea属内的一个新种,命名为Haliea atlantica sp.nov.,菌株 SM1351T(=CCTCC AB 2014266T =JCM 30304T)为该种的模式菌株。3.菌株SM1352T的多相分类研究菌株SM1352T分离自南极长城站长城湾潮间带沉积物样品。菌株SM1352T革兰氏染色反应为阴性,其触酶及细胞氧化酶为阴性。菌株SM1352T能还原硝酸盐。菌株SM1352T生长温度范围在4-35℃之间,其最适生长温度为25℃;菌株SM1351T生长的NaCl浓度范围是0.5-6.0%(w/v),最适盐浓度为2.0%。菌株SM1352T可水解七叶苷及DNA,但不能水解酪蛋白、弹性蛋白、酪氨酸、明胶及 Tween 80。菌株 SM1352T 的主要脂肪酸包含 C15:0,iso-Ci5:0,anteiso-C15:0,iso-C15:1G,iso-C16:0 3-OH及iso-C17:0 3-OH。菌株SM1352T的主要极性脂磷脂酰乙醇胺(phosphatidylethanolamine,PE)、五种未鉴定结构的脂类(L1-5)、两种未鉴定结构的含氨基磷脂(APL1-2)及一种未鉴定结构的含氨基的脂类(AL)。该菌的主要呼吸醌为甲基萘醌6(MK-6)。菌株SM1352T的基因组DNA的G+C含量为35.1 mol%。16S rRNA基因序列分析表明菌株SM1352T与Lutibacter agarilyticus序列相似度最高(93.2%)。基于16S rRNA基因序列的系统进化树显示菌株SM1352T在Flavobacteriaceae科内形成一个独立的进化分枝。基于上述数据,菌株SM1352T应属于Flavobacteriaceae科内的一个新属,命名为Magnivallibacter gen.nov.,而菌株SM1352T代表该属内的一个新种,命名为Magnivallibacer luteus sp.nov.,菌株 SM1352T(=CCTCC 2014243T=KCTC 42296T)是该新种的模式菌株。
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