算法交易已成为金融市场上一种重要交易方式,在欧美发达国家,投资者借助算法交易进行程序化下单的交易量目前已超过70%。在我国,算法交易于2010年起步,并于2011年得到蓬勃发展,2012年,我国已有20多家基金公司在运用算法交易。在算法交易的应用中,交易策略是算法交易中的核心问题,交易策略的优劣直接决定了投资者的盈亏。一个好的算法交易策略能够迅速的捕捉到金融市场上稍瞬即逝的价格差异,并及时的做出科学合理的买卖决策,为投资者增加收益的同时也提高了金融市场的运作效率。本文主要运用在线理论研究多支股票算法交易策略。首先,分析算法交易的研究现状,以及目前构建算法交易的主要理论和现有被广泛使用的算法交易策略。其次给出本文的股票选取策略,并运用DEA与马姆奎斯特TFP指数方法进行实证选股。再次,运用在线理论构造单支股票算法交易买入策略,证明该策略为最优在线策略；并将构造的单支股票交易策略应用到多支股票交易策略问题中,设计了多支股票算法交易策略,并以每支股票收益加权进行投资组合。最后,以本文设计的股票选取策略实证结果中所选股票为样本,根据被选股票的历史数据,实证验证本文设计的多支股票算法交易策略的有效性。结果表明：第一,本文所设计的股票选取策略在所选的100支股票中，月平均收益率大于零的有65支,表现较好。第二,本文所设计的多支股票算法交易策略对于所选的多支股票组合均有较好收益且收益相对稳定,在所做的100次试验中,收入大于初始资金的有68次,收入的最大方差为0.006,最小方差为2.38E-05。第三,在对交易周期分别选取10个偶数长度进行验证,发现交易周期为18天时平均收益最大,平均收益率为3.9%。第四,策略运行结果符合现实,好的股市行情比选好的股票和运用好的算法交易策略更重要。本文主要运用在线理论研究多支股票算法交易策略,旨在将在线理论运用在股票算法交易过程中,为投资者的投资活动提供理论依据和现实指导。