中国黄连木(Pistacia chinensis Bunge.)作为一种传统认为的雌雄异株植物,是中国北方地区优先考虑的油料树种。黄连木雄株多雌株少的现象导致了其栽培状况下的连续低产,因此雌雄异株成为了制约其增产的重要因素。近年来在华北地区发现的雌雄同株黄连木为研究植物性别分化过程提供了良好的试验材料,而雌雄同株黄连木性别分化相关差异蛋白组学的研究将有助于探明雌雄同株黄连木的性别决定机制,提供调控雌雄异株植物花芽性别分化的理论依据。本研究的目的是确定雌雄同株黄连木在两个花芽分化关键期中差异化表达的蛋白质,提供蛋白质水平线索,以确定雌雄同株黄连木的性别决定机制。研究采集了关键时期的雌雄同株黄连木花芽样品,提取并定量和检测样品蛋白,然后使用非标记定量技术对通过蛋白酶解获得的肽段进行LC-MS/MS分析,并对差异表达的蛋白质进行鉴定、注释及包括GO功能分析和信号通路分析在内的生物信息学分析,从而确定雌雄同株黄连木上雌花和两性花在两个花芽分化关键期中的差异蛋白表达及其相关的代谢通路。研究结果表明:(1)在两个分化关键期的两性花和雌花花芽中共成功鉴定出3750个有效蛋白,注释了无患子目的差异蛋白104个。(2)在当年5月末的雄性器官分化阶段,两性花芽与抗逆性、核糖体活动和光合功能相关的差异蛋白表达上调,说明此时两性花芽抗逆能力增强,核糖体活性增强,光合作用增强;在次年3月初的雌性器官分化阶段,两性花芽与抗逆性有关的差异蛋白表达上调,说明此时两性花芽抗逆能力增强。(3)与次年3月初相比,一些与抗逆性相关的差异蛋白仅存在于当年5月末雌花芽和两性花芽中且上调,而核糖体活动相关的差异蛋白表达均显著下调,说明当年5月末雌花芽和两性花芽的抗逆能力增强,核糖体活性减弱。(4)热休克蛋白90在关键期Ⅱ(次年3月初)的雌花芽与两性花芽中均没有表达,而在关键期Ⅰ(当年5月末)的两性花芽中显著下调。