【摘 要】
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目的:近期研究表明,TEA结构域家族成员4(TEAD4)在癌症的发生和进展过程中发挥着极为重要的作用。然而,TEAD4在膀胱癌进展中的潜在作用仍有待探索且至今尚未有文献报道。本研究的目的是确定TEAD4是否可以作为预测膀胱癌预后的泛癌生物标志物。方法:基于肿瘤基因组图谱数据库(TCGA数据库)及基因表达综合数据库(GEO数据库),我们下载了膀胱癌患者的基因组数据和相应的临床数据并利用R软件对临床数
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目的:近期研究表明,TEA结构域家族成员4(TEAD4)在癌症的发生和进展过程中发挥着极为重要的作用。然而,TEAD4在膀胱癌进展中的潜在作用仍有待探索且至今尚未有文献报道。本研究的目的是确定TEAD4是否可以作为预测膀胱癌预后的泛癌生物标志物。方法:基于肿瘤基因组图谱数据库(TCGA数据库)及基因表达综合数据库(GEO数据库),我们下载了膀胱癌患者的基因组数据和相应的临床数据并利用R软件对临床数据进行了整理,最终汇总了TCGA及GEO队列患者的临床信息。然后,通过生物信息学分析比较了TEAD4在膀胱癌组织和正常膀胱组织中的表达水平。紧接着,临床相关性分析被用来检测TEAD4的表达量与患者临床病理分期的关系。随后,我们根据TEAD4的中位值将膀胱癌患者分为高风险组和低风险组并采用生存分析分别对比了高风险组和低风险组间总生存期(OS)、疾病特异性生存期(DSS)及无进展生存期(PFS)的差异。接下来,采用单因素Cox回归分析比较TEAD4表达与其他临床特征与膀胱癌患者总生存期的关系,而多因素Cox回归分析被用来揭示了TEAD4是否可以作为预测膀胱癌患者预后的独立预后指标。定量逆转录PCR(quantitative reverse transcription PCR,RT-q PCR)被用来进一步验证膀胱尿路上皮癌细胞株与正常膀胱上皮细胞株中TEAD4的表达水平差异。TEAD4的蛋白水平也在人类蛋白质图谱数据库(HPA数据库)中加以检测。采用基因集富集分析(GSEA)进行功能分析。同理,表达差异分析、生存分析、临床相关性分析被再次应用于泛癌数据研究,探索TEAD4在其他32种肿瘤中的预后价值。最后,Ciber Sort算法用来计算21种免疫细胞在膀胱癌及32种泛癌组织中免疫细胞浸润水平,并可视化其与TEAD4表达的关系。结果:与正常膀胱组织相比,TEAD4在膀胱癌组织中高表达。临床相关性分析发现,在TCGA及GEO队列中TEAD4的表达水平与膀胱癌患者的组织学分级、病理分期等呈正相关关系。此外,与TEAD4低表达患者相比,TEAD4高表达组患者的总体生存期,疾病特异性生存期和肿瘤无进展生存期均更短。研究也发现在GEO队列中TEAD4高表达患者的总体生存期较差。多因素Cox回归分析显示TEAD4表达可以作为膀胱癌患者预后的独立危险因素。实时荧光定量PCR结果表明与正常SV-Huc-1细胞相比,膀胱癌细胞株TEAD4的表达水平明显上调。经HPA数据库验证,膀胱癌组织与正常膀胱组织间TEAD4蛋白表达水平差异与m RNA表达水平差异一致。利用患者临床信息(年龄、性别和分期)和TEAD4表达量构建了预测膀胱癌患者生存概率的列线图。校准曲线分析表明,与参考线相比,实际和预测的1、2、3年生存概率是一致的。根据GSEA分析的结果,我们发现TEAD4高表达组中包括免疫相关通路在内的多条途径被丰富。此外,在泛癌数据中的进一步分析表明TEAD4在多种肿瘤组织和正常组织中的表达差异明显,并且其表达与多种肿瘤的预后密切相关。最后,Ciber Sort算法表明,在膀胱癌及32种泛癌组织中多种免疫细胞浸润与TEAD4表达切相关。结论:TEAD4是一种与免疫调节相关的预测膀胱癌预后的生物标志物并在泛癌中具有推广价值。
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