目的：观察针刺督脉经穴对脑缺血再灌注大鼠缺血半暗带微管相关蛋白MAP-2和神经丝蛋白NF-L的mRNA表达的影响；探讨针刺督脉经穴对缺血再灌注损伤脑组织的神经保护作用机制。　　 方法：将实验动物分为正常组、假手术组、模型组、针刺组和对照组。以线栓法制作局灶性脑缺血再灌注大鼠模型，在造模成功后一小时进行督脉经穴针刺和传统经穴针刺（针刺阳明经穴），观察各组大鼠针刺干预前后神经功能评分的变化，并于24h后断头取脑，采用实时定量PCR方法检测各组大鼠在针刺干预前后脑组织缺血半暗带MAP-2和NF-L的mRNA表达的变化情况。　　 结果：(1)神经功能评分：针刺督脉穴组与针刺阳明经穴组治疗前后评分均有显著性改善(P＜0.05)，针刺督脉穴组较针刺阳明经穴组大鼠缺损的神经功能改善更显著(P＜0.05)。　　 (2)MAP-2和NF-L的mRNA表达：正常组和假手术组大鼠脑组织中MAP-2和NF-L的mRNA均呈基础水平表达；模型组MAP-2和NF-L的mRNA表达较正常组显著降低(P＜0.01)；针刺督脉经穴和针刺阳明经穴组与模型组比较均显著升高(P＜0.01)，但仍低于假手术组和正常组，但针刺督脉经穴组较针刺阳明经穴组有更显著的效果(P＜0.05)。　　 结论：针刺督脉经穴较针刺阳明经穴能更显著地改善脑缺血再灌注后大鼠的神经功能损伤，且更加显著地升高缺血再灌注大鼠脑组织中MAP-2和NF-L的mRNA表达，从而更有效地促进神经元树突和轴突的出芽和再生，提高神经元的可塑性，改善神经功能缺损状态，发挥神经保护作用。