行政指导是指行政主体在其职权和所辖的事务范围内出于行政管理和社会发展需要,在法律框架内通过辅导、协助、劝告、建议或其他非强制性方法对相对人施加影响,使其做或不做一定行为的行为。作为一种柔性的行政手段,在战后以日本为代表的国家得到了广泛的应用并得到了很好的实施效果,极大促进了经济和社会的发展。出入境检验检疫机构是我国进出境产品质量和安全的把关者,也是防控疫情疫病传入传出的守护者,肩负着重要的使命。随着经济的发展和社会的进步,出入境检验检疫机构的政府职能也在不断发生着变化,由过去的“把关”到“把关和服务并举”,现代公共管理观念和手段的应用,也使出入境检验检疫机构行政能力得到了很大的提升,行政指导这种非强制性的行政手段,也大量应用于检验检疫的实践中。本文从行政指导和出入境检验检疫的基本理论出发,分析行政指导的涵义和其在出入境检验检疫工作中应用的价值,并以行政指导在吉林出入境检验检疫局的实践为例,分析了行政指导在出入境检验检疫工作中应用的现状和存在的问题,最后提出了完善行政指导在出入境检验检疫工作中应用的建议。