内毒素休克小鼠RIG-I基因启动子结合蛋白的筛选及鉴定

来源 :贵阳医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:upup2004
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目的:维甲酸诱导基因Ⅰ(retinoic acid-induced gene,RIG-Ⅰ)具有抗病毒、杀灭微生物、抗肿瘤、介导免疫反应等生物学作用,并在机体多种组织和细胞中都有表达,不同刺激在不同细胞、不同种系可能通过不同的信号通路诱导RIG-Ⅰ基因的表达,相关的调控机制也不尽相同。目前对人源性RIG-Ⅰ基因相关的调控机制及其在内毒素休克模型中的表达机制则知之甚少。因此我们的实验目的旨在了解内毒素休克中哪些蛋白参与了人RIG-Ⅰ基因的表达调控。  方法:用RT-PCR方法检测LPS对小鼠肝组织RIG-Ⅰ mRNA表达的影响;腹腔注射LPS法制备内毒素休克小鼠模型;用核质分离的方法提取正常小鼠和内毒素休克小鼠肝组织核蛋白;设计合适的引物,用PCR方法扩增人RIG-Ⅰ启动子探针;然后从“组学”的角度和活体组织水平,根据DNA-蛋白质相互作用的原理,基于生物素-链亲和素系统、磁珠分离技术,2-D DIGE分离差异蛋白等技术筛选正常小鼠和内毒素休克小鼠肝脏组织中能与人RIG-Ⅰ启动子发生相互作用的结合蛋白;并用质谱技术对筛选出来的部分蛋白进行质谱鉴定;最后利用生物学软件对鉴定出来的蛋白进行简单的功能查找及蛋白亚细胞定位分析。  结果:小鼠肝组织RIG-Ⅰ mRNA的表达与LPS刺激存在着时间依赖的关系,LPS(25mg/kg)腹腔注射小鼠后,小鼠肝组织中RIG-Ⅰ mRNA的表达先增多后减少;颈动脉插管,LPS(25mg/kg)腹腔注射小鼠后,150min时小鼠平均动脉血压降低至40mmHg,提示内毒素休克小鼠模型制备成功;用SDS-PAGE方法分离了正常小鼠和内毒素休克小鼠肝组织胞浆蛋白和胞核蛋白,胞浆蛋白和胞核蛋白带型明显不同,提示小鼠肝组织核蛋白提取成功;用DNA-Pull down分析、2-D DIGE技术、质谱技术综合分析后得到15个可能参与人RIG-Ⅰ启动子转录调控相关的蛋白分子,分别为:四联重复肽蛋白29(Tetratricopeptide repeat protein29)、转录辅助因子HES-6(Transcription cofactor HES-6)、丝裂原活化蛋白激酶激酶激酶7(Mitogen-activated protein kinase kinase kinase7)、钙蛋白酶-6(Calpain-6)、钾电压门控通道亚科F成员1(Potassium voltage-gated channel subfamily F member1)、张力蛋白-3(Tensin-3)、Rho鸟嘌呤核苷酸交换因子1(Rho guanine nucleotideexchange factor1)、组氨酰-tRNA合成酶(Histidyl-tRNA synthetase)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶TAO3(Serine/threonine-protein kinase TAO3)、富含亮氨酸重复和WD重复蛋白1(Leucine-rich repeat and WD repeat-containing protein1)、E3泛素蛋白连接酶HUWE1(E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1)、细胞分裂蛋白激酶18(Cell division protein kinase18)、40S核糖体蛋白SA(40S ribosomal proteinSA)、核不均一核糖核蛋白A3(Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3)、延伸因子1(Elongation factor1-delta);最后用生物学软件对鉴定出来的蛋白进行了简单的功能查找及亚细胞定位分析,结果显示这15种蛋白功能多样,部分蛋白显示与基因的转录调控有关;15个蛋白中有11个蛋白有定位在细胞核的潜能。  结论:本研究利用DNA-蛋白质相互作用的原理,从“转录调控组学”的角度分析内毒素休克小鼠肝脏中人RIG-Ⅰ基因的转录表达调控,结果显示可能有多种核蛋白或转录因子参与了这一过程。对这些蛋白的鉴定和生物信息学分析有助于我们深入理解RIG-Ⅰ基因表达调控,同时也将为临床治疗内毒素休克提供新的理论依据及可能的治疗靶点。
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