野鸟是低致病性禽流感病毒的自然储存库,病毒传播与候鸟迁徙的关系也是国际上禽流感监测的研究热点。渤海湾和福建闽江河口是水鸟南北迁徙的重要中转站,也是东亚-澳大利西亚候鸟迁徙路线的重要组成部分,每年有大量水鸟在渤海湾和福建闽江河口停歇,促进了禽流感病毒的传播。为了解渤海湾和福建闽江河口禽流感病毒的传播和进化与水鸟迁徙的相关性,我们对水鸟的环志回收数据进行了处理,同时分析了鸻鹬类、雁鸭类和鸥类的环志回收数据,研究渤海湾和福建闽江河口地区水鸟迁徙的情况。2017年4月和2018年4-5月春季迁徙期间,分别在渤海湾和福建闽江河口采集鸻鹬类粪便样品3000余份,对样品进行处理及检测,其中福建闽江河口的样品中分离出8株禽流感病毒,分别为7株H2N6亚型的病毒和1株H4N6亚型的病毒;渤海湾的样品中分离出3株禽流感病毒,1株H4N6亚型的病毒,1株H2N7亚型的病毒和1株H2N8亚型的病毒。对这11株禽流感病毒进行了分子特征及遗传进化分析,同时结合病毒的重组及遗传进化和水鸟迁徙的分析,探究渤海湾地区和福建闽江河口地区禽流感病毒传播与野鸟迁徙间的关系。通过对水鸟的环志回收数据的分析,东亚-澳大利西亚迁徙路线上有大量鸟类在我国东部沿海如渤海湾、福建等地停歇,也有水鸟在中亚通道与东亚-澳大利西亚通道间迁徙。11株分离株的HA蛋白裂解位点符合低致病性禽流感病毒的分子特征,但有潜在的毒力增强的趋势。福建8株病毒的同源性较高,并与河北897毒株的亲缘关系很近,表明病毒会从福建传播到渤海湾地区。河北854、240毒株与河北879毒株和福建毒株的亲缘关系较远,8个基因片段分别与蒙古、日本、韩国、俄罗斯、孟加拉等地的同源性较高。通过对11株病毒的全部8个基因片段的分析发现,病毒在欧亚大陆、北美大陆和澳大利亚间存在基因交流现象。研究表明,渤海湾和福建闽江河口的禽流感病毒的传播与鸟类的大规模迁徙和聚集有密切联系,并且可能在中亚和东亚-澳大利西亚两条候鸟迁徙通道间进行传播。