番茄叶夹角基因的精细定位

来源 :中国农业科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kary_yeah
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株型是影响植物产量的重要因素,而叶夹角是影响番茄株型的重要部分。叶夹角是指叶片相对主茎的锐角角度,通常会影响植物的光合效率、种植密度等,是番茄品种选育、栽培研究和生产实践上的重要性状。叶夹角的生长发育受到遗传因素、植物激素、环境的共同影响,是个十分复杂的生物学过程。本课题主要对番茄叶夹角进行遗传分析和精细定位,希望能够找到控制番茄叶夹角的基因,为番茄叶夹角性状基因的克隆提供依据,主要研究内容和结果如下:1.遗传分析结果显示,番茄叶夹角性状由两个主效基因控制。本研究调查了以Heinz 1706(叶平展)为母本,以161-817(叶上举)为父本构建的F2群体200个单株的叶夹角的度数,统计结果显示,该F2群体的表型呈连续分布,表明番茄叶夹角是由多基因控制的数量性状;2.利用混池分析结合QTL作图,在10号染色体上找到了2个与番茄叶夹角相关的主效QTL。首先构建平、举基因池,利用236个多态性分子标记对两个极端池进行分析,发现仅在10号染色体呈现多态性差异。进一步在10号染色体上利用10个多态性标记对F2群体进行QTL分析,最终检测到2个与叶夹角相关的主效QTL,遗传贡献率分别为为18.7%和22.5%,将这两个主效QTL命名为LA1-1和LA1-2;3.通过筛选重组单株和加密目标区域分子标记,进一步将LA1-1位点定位于10号染色体分子标记A-10和A-5之间,物理距离为1.5Mb。根据番茄基因注释信息,该区域编码210个基因。对候选基因序列进行分析,发现其中4个基因存在非同义突变,分别为Solyc10g008620、Solyc10g008970、Solyc10g008990、Solyc10g009055,这几个基因均有可能为LA1-1的候选基因;4.将LA1-2精细定位于10号染色体分子标记B-3和B-9之间,物理距离为378kb,该区域编码32个基因,对候选基因序列进行分析,发现有5个基因存在非同义突变,其中Solyc10g054760在第一个外显子区域发生了SNP突变,碱基由G突变为T,从而导致精氨酸变成甲硫氨酸,进一步对该基因进行表达分析发现Solyc10g054760在161-817中表达高。Solyc10g054760属于SAUR(生长素响应基因家族)的一员,SAUR基因家族成员被认为参与生长素信号传导途径,该基因可能为LA1-2的候选基因。
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