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罗氏沼虾（Macrobrachium rosenbergii）又称马来西亚大虾,隶属节肢动物门,甲壳纲、真虾总目、十足目、长臂虾科、沼虾属。原产于亚洲南部、太平洋北部等热带亚热带地区。自1976年从日本引入我国,凭借个体肥壮、肉质鲜美、生长快、抗病强、易于养殖等优点,加上人工育苗技术的突破和推广养殖,罗氏沼虾迅速在全国各地推广开来。但是,经过长期无规范的生产繁殖以及环境恶化等因素,出现了病害增多、成活率下降、个体小型化、生长速度缓慢、早熟、抗逆性减弱等标志着种质退化的现象日渐突出,尤其是近几年池养罗氏沼虾种质资源退化现象越来越普遍,严重影响沼虾的养殖生产和经济效益。目前对于罗氏沼虾种质资源以及良种选育的工作已经有所开展,如南太湖1号、南太湖2号选育种。为进一步促进罗氏沼虾苗种的生产,本论文首先从虾类表型、遗传等自身因素出发,对通过配套系选育构建于上海申漕特种水产开发有限公司的罗氏沼虾生长快专门化选育系子七代及上海本地非选育群体进行单因素完全随机试验生长对比,然后利用25对多态性良好的微卫星引物对其罗氏沼虾五个生长快专门化选育系进行遗传多样性分析,并利用双列杂交设计将罗氏沼虾5个生长快专门化选育系组建25个配套组合,应用加性—显性遗传模型对各杂交组合子代5个生长形状进行配合力分析,分析其配合力、杂交优势和遗传力等,筛选出高效配套组合。然后,为对本实验室选育的泰国野生、生长快和抗病专门化选育系的不同世代进行遗传多样性的微卫星分析,对选育过程中各专门化选育系群体、各世代进行评估来探讨罗氏沼虾的选育现状和遗传潜力,筛选出可以用于有效检测选育效果的微卫星位点。为罗氏沼虾分子辅助选育提供理论基础。具体内容如下:1罗氏沼虾生长快专门化选育系子七代生长对比及其遗传多样性分析对罗氏沼虾5个生长快专门化选育系子七代A2、A3、B3、C2、C3和作为对照组的上海本地非选育罗氏沼虾群体进行生长性能测定和比较分析。选育系A2、A3、B3、C2、C3的实验末重均高于对照组,相对增重率分别为33.33%、110.73%、53.67%、85.28%、47.17%。5个选育系的绝对增重率均显著大于对照组上海本地非选育群体F,大小顺序为A3＞C2＞B3＞C3＞A2＞F。选育的子七代选择系中A2、B3、C3符合选育体型的比例都有所增加;而A2、C2选择系符合体型的比例略有下降。利用实验室自主开发的25对微卫星分子标记引物对罗氏沼虾5个选择系子七代与上海本地非选育群体进行遗传多样性分析。结果表明,A3的各项遗传多样性指标较低,观测等位基因数（Na）为1.92,平均有效等位基因数（Ne）为1.585,观测杂合度Ho为0.348,期望杂合度He为0.308,多态性信息PIC含量为0.247,属于低度多态性。A2与F群体遗传多样性比其他群体的PIC高,属于中度多态性。通过对比不同群体的遗传多样性可以看出,选育群体的选育效果明显。2罗氏沼虾5个生长快专门化选育系子七代配套选育系杂交效果的配合力、遗传力及杂种优势分析本实验中5个生长性状没有检测到一般配合力,说明这5个性状主要是由基因的非加性效应控制的。配套组合均能检测到特殊配合力,其中A3×C2组合特殊配合力值及特殊配合力预测值均较优,体现了较好的正向杂交效应。而自交组合和B3×C3组合体长、体重均呈现出负向效应。5个选择系子七代通过双列杂交的子一代均表现出较好的杂种优势。杂交组合在平均杂种优势（HM）和超亲杂种优势（HB）上大部分呈现出正向效应,HM和HB的预测值也与之相匹配。其中杂交优势较大的是A3×C2、B3×C2、A3×B3组合,表现出杂种优势,这与第一章中A3选择系与其他选择系的遗传距离较大的结果相匹配。本实验研究表明,A3×C2、B3×C2、A3×B3组合表现出较大的杂种优势,该结果可以帮助我们更好的完善和改进下一步选育工作。3罗氏沼虾不同选育群体遗传多样性的分析研究罗氏沼虾各群体世代的遗传多样性,为罗氏沼虾专门化选育系的选育和遗传改良提供理论依据。利用25对多态性良好的微卫星标记对泰国群体、生长快和抗病专门化选育系群体的不同世代进行遗传多样性分析。泰国群体3个世代遗传多样性水平均呈逐代降低的趋势,有效等位基因数从2.5937下降到1.8565、期望杂合度从0.5641下降到0.4280,多态性信息含量从0.5008下降到0.3630。生长快专门化选育系遗传多样性水平均呈逐代降低的趋势,SA3选育系多态性信息含量从0.3827下降到0.2560,SC2选育系多态性信息含量从0.3877下降到0.2557;抗病专门化KB3选育系多态性信息含量从0.2952下降到0.2845,KA2选育系多态性信息含量从0.3721下降到0.2974,世代间不存在显著性差异（P＜0.05）;抗病专门化选育系F2的期望杂合度（KB3:He=0.358,KA2 He=0.3602）大于同时期选育的生长快专门化选育系F3（SA3:He=0.3188,SC2:He=0.3131）。配套系选育会使各世代遗传多样性指标下降,可以作为生长快专门化选育系选育效果的评价标准。而抗病专门化选育系选育标准需要结合杂合度变化、感染存活率和养殖成活率等其他标准综合评价。