科技经费是国家的战略资源，是科技竞争能力和国家发展潜力的基础。科技经费的配置和利用情况对科技创新活动、经济发展、民生改善和国家安全等具有长远、深刻、广泛的影响。有效配置科技经费，提高科技资金使用绩效是科技工作者的共同责任，也是全社会的关注焦点。本文分析了委托-代理理论、信息不对称理论、寻租行为和科研激励机制等科技经费监管的相关理论。对国内外科技经费监管的经验进行了总结，国外重点分析了美国和日本的做法，国内对重庆市、天津市和江西省三个地区在科技经费监管方面的成功之处进行了总结，得出了科技经费监管的一些有益启示。在此基础上，笔者对现阶段湖南省科技经费监管的现状、存在的主要问题以及问题的成因进行了深刻剖析，认为湖南省科技经费监管存在投入结构不合理、监管方式不健全、绩效管理不到位等问题，这些问题是由经费预算不合理、审计制度不规范、审计方面的缺陷造成的。据此，论文有针对性地提出了强化湖南省科技经费监督管理的具体对策，对策从事前监管、事中监管和事后监管三个方面展开，其中事前监管主要是深化经费预算编制管理，事中监管主要是加强预算执行管理、规范经费监督的内容，事后监管主要是财务检查验收和经费的绩效评价。在当前加快转变经济发展方式、推动经济增长转型迫切形势之下，科技经费监管成为湖南省科技创新工作中不容忽视的一项重要任务。本文为科技经费监管研究提供了系统科学的方法，不但丰富了科技经费监管的理论研究，而且对湖南省科技经费的管理具有实际的指导意义。