玉米C型细胞质雄性不育花粉败育相关microRNA鉴定分析

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bluelink
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
细胞质雄性不育(cytoplasmic male sterility,CMS)在多种植物中发现并广泛应用于植物杂交种子生产。miRNA作为植物体内一类重要的调控因子,几乎参与植物生长发育的各个组织、各个时期,研究表明一些miRNA在植物花粉中大量存在,预示着这些miRNA可能与植物花发育相关,也很可能参与调控植物育性。但有关育性相关miRNA报道多数存在于模式植物如拟南芥、水稻等,而对玉米育性相关尤其玉米C型胞质雄性不育相关miRNA的分析研究报道甚少。本研究通过Hi-Seq高通量测序技术对玉米细胞质雄性不育系C48-2及其保持系N48-2花粉母细胞时期及单核期花药中显著差异表达的miRNA并作初步功能分析,以期寻找与育性相关miRNA。同时对挖掘到的可能与育性相关的miRNA作进一步靶基因预测分析,初步探讨本实验预测到的miRNA可能参与的生物学过程。现将本实验的主要研究结果归纳如下:1.对两个材料两个时期构建的sRNAs文库进行Hi-Seq高通量测序分析共获得321个已知miRNA,属29个miRNA家族;并通过进一步分析,获得724个新的miRNA。2.生物信息学分析发现保持系N48-2在花粉母细胞时期与单核期存在显著差异的miRNA共有24个,其中已知miRNA有15个,新miRNA有9个;不育系C48-2在花粉母细胞时期与单核期存在显著差异的miRNA共有8个,均为已知miRNA;保持系N48-2和不育系C48-2在花粉母细胞时期存在显著差异的miRNA共有21个miRNA,其中已知miRNA有15个,新miRNA有6个;保持系N48-2和不育系C48-2在单核期存在显著差异的miRNA共有19个,其中已知miRNA有11个,新miRNA有8个。既在保持系N48-2花粉母细胞和单核期存在显著差异,又在不育系C48-2和保持系N48-2的单核期存在显著差异的 miRNA 有 6 个,分别为 miR159h-3p,miR167h-3p,miR171-5p,miR3449-3p,miR5141,mir41;这 5 个已知 miRNA 和 1 个新 miRNA 是否与玉米C型细胞质雄性不育系育性有关有待进一步研究。3.通过miRNA加尾及RT-PCR的方法对上述经过生物信息学预测得到的可能与育性有关的6个miRNA进行生物学实验验证,实验结果表明,除miR5141在不育系和保持系单核期的表达趋势与生物信息学分析不一致外,其余5个miRNA表达趋势均与生物信息学分析一致。对在保持系N48-2和不育系C48-2单核期差异极显著表达的6个新miRNA(mir83,mir81,mir225,mir239,mir182,mir175),以及在保持系N48-2和不育系C48-2单核期表达差异极显著但有研究发现可能参与花药发育的miR2111-3p和miR444b.2用生物学实验对其生物信息学分析结果的差异表达趋势进行验证,结果表明,6个新miRNA以及miR444b.2与生物信息学预测表达趋势一致,而miR2111-3p表达趋势相反。4.用 psRobot 和 TargetFinder 软件对上述 14 个 miRNA(miR159h-3p,miR167h-3p,miR171-5p,miR3449-3p,miR5.141,mir41,mir83,mir81,mir225,mir239,mir182,mir175,miR2111-3p,miR444b.2)的靶基因进行预测分析发现,miRNA参与植物生长发育的多个方面,包括能量代谢(ATP-binding),激素传递(NAPK信号通路、磷脂酰肌醇信号系统),转录调控(protein-binding)等生物学过程,彰显了 miRNA调控植物生长发育的复杂性。5.对14个miRNA的靶基因qRT-PCR分析发现,仅mir182在不育系C48-2单核期(CU)中表达显著高于保持系N48-2单核期(NU),而其靶基因(Gene ID:100193686)则在不育系C48-2单核期(CU)中表达水平显著低于保持系N48-2 单核期(NU)。一些 miRNA(miR159h-3p,miR167h-3p,miR171-5p,miR3449-3p,mir41,mir225,miR2111-3p,mir444b.2)的表达趋势与其相应的靶基因并无对应的显著性关系。可能的原因有三个,一是候选靶基因可能会有一些假阳性,二是miRNA可能与其他因子共同调控其靶基因影响花药发育,三是miRNA通过微调其下游靶基因行使相应的功能。6.通过构建miR171-5p以及miR444b.2前体过表达载体,并将其导入野生型拟南芥中,观察T1代阳性苗表型发现,过表达miR171-5p或miR444b.2都将会导致拟南芥育性降低,因此我们推测miR171-5p,miR444b.2可能与玉米CMS-C育性相关。
其他文献
在高考的《考试说明》中有七大能力要求,其中的一项就是“运算求解能力”,对此能力的要求是:会根据法则、公式进行正确运算、变形和数据处理,能根据问题的条件寻找与设计合理、简捷的运算途径,能根据要求对数据进行估计和近似计算.怎么“根据要求对数据进行估计和近似计算”?我们先看一例:  例1. 函数y=3sin(x 20°) 5sin(x 80°)的最大值是( )  A. 5 B. 6 C. 7D. 8  
2007年1月4日,考生们期待已久的《2007年普通高等学校招生全国统一考试的说明(广东卷)》(简称《考试说明》)正式出台。《考试说明》和教育部颁布的《考试大纲》将是2007年我省普通
数控机床作为机械加工领域最重要的生产设备,支撑着国家制造产业。随着制造业近年来智能化的发展方向,数控机床的智能化也成为趋势。机床的状态监测作为其智能化的基础,是保
以高纯度的NiO、ZnO、Fe2O3为原料,采用氧化物陶瓷工艺制备了高Bs NiZn铁氧体材料。通过岩崎B—H Analyzer SY-8232、Agilent 4285A和4284A多频LCR测试仪分析了NiO含量对材料的
今年是第三代稀土永磁——钕铁硼(NdFeB)问世的第25周年。烧结NdFeB磁体的磁能积由当初的35MGOe[1](1983)提升到57.8MGOe[2](2004),现更升至59.6MGOe[3](2006)。各向同性NdFe
一篇作文光有艳丽的外表,里面却是一团烂棉絮,只能给人华而不实的感觉。文如其人,我们不能做“金玉其外,败絮其中”的空腹花瓶,我们的作文应该是籽满实沉的结晶。作文要想得高分,必
在学习中,我们经常发现同学们对某些高考高频类数学问题不能很好地解决.其实,这些问题不管以何种形式考查,只要同学们掌握解决问题的客观规律,就能轻松获得分数.本文给同学们支三类问题的突破规律,并希望同学们能举一反三,在其他各章节中也能类似的进行有效总结并应用.  一、等差数列类比到等比数列的规律  在高考中,等差数列与等比数列的类比问题时有出现,这部分题对同学们具有一定的困难,其实,此类问题是有规律可
点击考纲:《2010年广东省语文考试大纲的说明》对文学类文本阅读作出这样的说明:“阅读鉴赏中外文学作品。了解小说、散文、诗歌、戏剧等文学体裁的基本特征及主要表现手法。文学作品的阅读鉴赏,注重审美体验。感受形象,品味语言,领悟内涵,分析艺术表现力;理解作品反映的社会生活和情感世界,探索作品蕴涵的民族心理和人文精神。”  点击高考:纵观2009年高考试卷,考查到小说的试卷有安徽卷、四川卷、福建卷、浙江
详细总结了磁流变器件对磁流变液性能指标的要求,概括了磁流变器件的工作模式,研究了磁流变器件结构参数的设计要点.从磁芯材料选择、磁场方向确定和磁路设计步骤三方面总结了磁