外泌体microRNA-146a-5p在非小细胞肺癌中的生物学功能研究

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Bai_cat
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目的:肺癌一直是影响人类生命健康的全球性公共卫生问题,我国肺癌发病率和死亡率持续上升,造成了巨大的疾病负担。非小细胞肺癌是肺癌的一个主要病理分型,由于早期症状难以发现,导致大多数肺癌患者在肺癌晚期才被诊断,治疗效果和预后都不佳。最近的研究表明,非小细胞肺癌的发生和发病与基因的异常表达密切相关,可以作为诊断和判断预后的依据。外泌体是直径在30到150纳米之间的细胞外囊泡,可以在细胞间传递miRNA、长非编码RNA和其他小分子内容物。越来越多的研究表明,外泌体miRNA可以影响癌症的发展、进展和转移。miR-146a-5p在多种人类癌症中表达升高或降低,扮演着促癌或抑癌作用。通过阅读文献发现miR-146a-5p在非小细胞肺癌中的相对表达量及作用存在争议,但大多数研究集中在组织中miR-146a-5p的相对表达,因此本研究探讨了外周血与外泌体中miR-146a-5p的表达量及其临床意义,并通过体外细胞实验探讨其生物学意义,最后通过生物信息学预测靶基因及其在非小细胞肺癌中可能参与的通路,为miR-146a-5p在非小细胞肺癌中的作用提供一定的参考。研究方法:首先通过GEO数据库中搜索和下载非小细胞肺癌外周血的芯片数据,分析miR-146a-5p的表达情况并对miR-146a-5p的表达水平用Stata 14进行连续型变量标准化均数差的meta分析。同时,我们收集了非小细胞肺癌患者血浆和临床信息,提取外泌体,通过高通量测序和荧光定量PCR(q RT-PCR)技术分析miR-146a-5p的在外泌体中表达量,做出ROC曲线分析其诊断效能。通过Kaplan Meier法探究其与非小细胞肺癌患者预后的关系。细胞实验中,首先通过q RT-PCR检测miR-146a-5p在肺腺癌细胞系A549、肺鳞癌细胞系SK-MES-1和人正常肺上皮细胞系BEAS-2B中的表达水平。接着,将miR-146a-5p mimics转染到A549和SK-MES-1细胞系,改变细胞内miR-146a-5p的表达,检测非小细胞肺癌细胞的增殖能力和凋亡。通过q RT-PCR检测A549、SK-MES-1和BEAS-2B外泌体中miR-146a-5p的表达,提取BEAS-2b的外泌体,与A549和SK-MES-1细胞共培养,并检测非小细胞肺癌细胞的增殖能力和凋亡情况。利用生物学信息网站(miRDB、miRDIP),预测miR-146a-5p的靶基因。并利用DAVID生物信息学网站预测对靶基因进行GO分析,探讨靶基因富集的通路及在癌症中的作用。在TCGA数据库中下载和分析非小细胞肺癌中PSMC6表达数据,利用GSEA基因集富集分析根据表达水平进行功能富集分析得到靶基因PSMC6相关功能,并对PSMC6对非小细胞肺癌预后的影响进行探讨。结果:首先通过GEO数据库中搜索和下载非小细胞肺癌外周血的芯片数据,分析miR-146a-5p的表达情况,在检索的11个GSE数据集中,GSE40738、GSE27486、GSE61741、GSE135918、GSE68951、GSE64591中miR-146a-5p的表达水平低于正常组,GSE27486、GSE64591中的差异具有统计学意义;对结果进行标准化均数差(SMD)的meta分析,检测的Z值为0.55,P值为0.580,异质性检验I~2=86.4%,P<0.001,菱形与无效线相交,表达差异无统计学意义(P>0.05);外泌体miRNA测序结果与q RT-PCR结果均显示外泌体miR-146a-5p在非小细胞肺癌患者中显著下调(P<0.01);ROC曲线下面积为0.712,95%置信区间(0.616,0.808),P<0.0001,有较好的诊断效能;将外泌体miR-146a-5p的表达量根据中位数分为高表达组与低表达组,两组生存曲线整体比较的Log Rank检验结果为P=0.526,差异没有统计学意义。q RT-PCR结果显示,miR-146a-5p在非小细胞肺癌细胞和外泌体中呈低表达,细胞功能学实验结果显示与对照组相比,miR-146a-5p表达上调可抑制非小细胞肺癌细胞增殖,并对细胞凋亡产生促进的作用。生物信息学预测miR-146a-5p可能参与Wnt信号通路。应用miRDB等生物信息学网站预测PSMC6可能为miR-146a-5p下游靶基因;TCGA数据库中PSMC6在非小细胞肺癌呈高表达,且PSMC6差异表达与肺腺癌患者预后显著相关;GSEA结果预测PSMC6可能参与Wnt信号通路。结论:1.miR-146a-5p在非小细胞肺癌外泌体中低表达,具有良好的诊断效能。2.外泌体miR-146a-5p可以抑制非小细胞肺癌细胞增殖同时促进癌细胞凋亡。3.PSMC6可能为miR-146a-5p的靶基因,通过Wnt信号通路调控非小细胞肺癌的发生发展。
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