生物体中的肽具有极其重要的生理功能，在细胞内发挥一定的生物活性，因此研究肽的性质是非常必要的。本文研究了小分子肽及二肽分子不同构象的总能量。　　 本文把原子—键电负性均衡方法(ABEEMσπ)和分子力场(MM)结合在一起，采用ABEEMσπ/MM方法的分子总能量计算方法，计算小分子肽及二肽分子不同构象的总能量。首先，通过计算模型分子的总能量调节不同类型的原子价态能量参数，进而计算小分子肽的总能量。把所得的分子总能量结果与从头算(MP2/6—311++G(d，p))方法计算的结果相比，得出小分子肽总能量的绝对偏差小于9．0000 kcal/mol，相对偏差小于19．0000×10—6，且均方根偏差3．4500 kcal/mol，相对均方根偏差6．9190×10—6西。其次，又对二肽分子不同构象的总能量进行了计算，所得的分子总能量结果与从头算(MP2/6—311++G(d，p))方法计算的结果相比，得出二肽分子不同构象总能量的绝对偏差小于2．0000 kcal/mol，相对偏差小于4．0000×10—6，且均方根偏差1．0647 kcal/mol，相对均方根偏差2．7016×10—6。以上结果表明，ABEEMσπ/MM方法计算的分子总能量结果与从头算(MP2/6—311++G(d，p))方法计算的结果具有较好的一致性，同时，也说明所调的原子价态能量参数具有很好的可转移性。此外，应用ABEEMσπ/MM方法计算分子总能量远远快于从头算(MP2/6．311++G(d，p))方法。这些工作为以后计算更大的生物肽分子总能量及其相关性质等奠定了良好的基础。