[目的]研究吴茱萸的道地性,对吴茱萸适宜性产区进行区划,为吴茱萸的栽培引种提供科学参考。[方法]逐年调查吴茱萸资源状态和变化趋势；采用HPLC法对不同时期、年份、产地、品种的吴茱萸有效成分吴茱萸碱、吴茱萸次碱、吴茱萸内酯含量进行分析；采用RAPD、SRAP、AFLP分子标记技术研究吴茱萸遗传背景差异。从有效成分含量和遗传多样性角度分析吴茱萸的道地性；利用中药材产地适宜性分析平台TCMGIS-Ⅱ分析吴茱萸适宜产区。[结果](1)吴茱萸资源分布广泛,江西,贵州、湖南地区蕴含量最高；吴茱萸采收时间各地略有差异,以浙江沿海地区最早,而以贵州、广西等地较晚。(2)吴茱萸遗传多样性总体处于中下水平,其中石虎变异较吴茱萸大,浙江地区种群比较独立,贵州铜仁、湖南新晃道地产区种群遗传距离较近。(3)不同成熟期吴茱萸碱、吴茱萸次碱、吴茱萸内酯含量变化较大,以2-3周增加速度最快,一个月左右达到较高水平；不同年份的品质变化较大,主要受气候条件影响；同一品种不同产地有效成分含量石虎、疏毛品种随产地变化明显,可能是其道地性的一个表现；同一产地不同品种有效成分含量有差异,以石虎最高,疏毛吴茱萸次之。(4)产区区划分析显示与道地产区相似度为95-100%的吴茱萸适宜区主要分布在贵州省和湖南省；90-100%适宜产区主要有两个,一个是以贵州东部、湖南西部为中心的西南地区,另一个是浙江沿海地区；80-100%的适宜区在南方沿海省份成明显带状分布。[结论](1)吴茱萸资源蕴藏量大,采收加工有差异,受市场价格影响较大,近年虽受低价冲击,但恢复生产快。(2)吴茱萸药材以石虎、疏毛的道地性明显,且道地性与遗传多样性有关。吴茱萸药材品质受采收期、年份、品种、产地等因素的影响。(3)吴茱萸适宜产区分布规律明显,主要有两个适宜分布区即湖南西部、贵州东部等西南地区和浙江沿海地区。