二花脸猪生长曲线绘制及其启动子区变异与ACSL1基因的相关性分析

来源 :南京农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:george_zg
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作为猪最重要的两类脂肪性状,背膘厚与肌内脂肪含量对猪的肉品质影响很大,降低背膘厚度并提高肌内脂肪含量是改善肉质的有效途径。ACSL1基因对动物的脂肪沉积有着重要的影响,因此建立二花脸猪的脂肪性状生长曲线,筛选ACSL1基因启动子区域的突变点和研究不同基因型与脂肪性状的关联性等内容对于降低二花脸猪背膘厚度和提高肌内脂肪具有非常重要的意义。按照相关试验规范设计如下方案:试验一:二花脸猪脂肪性状的生长曲线研究本研究选取14头同窝的二花脸猪,从3月龄起连续5个月对其进行体重称量、B超测定活体背膘厚和肌内脂肪含量。根据测得的二花脸猪体重数据,运用三种模型Logistic、Gompertz、Bertalanffy体重模型对二花脸猪的体重生长曲线进行模拟。在脂肪性状上,采用Nlmixed背膘模型对二花脸猪的活体背膘厚进行拟合,同时寻找拟合度更好的活体背膘厚以及肌内脂肪含量的生长模型。结果发现:1)四种体重生长模型的拟合度分别为0.956、0.965、0.968和0.965。综合拟合度与生长日龄拐点和体重拐点等数据,我们得出Bertalanffy模型为二花脸猪的最适体重生长曲线。2)二花脸猪脂肪性状上,Gaussian模型对活体背膘厚的拟合效果要好于Nlmixed模型。Gaussian和Nlmixed模型拟合度R2分别为0.849和0.719。3)活体肌内脂肪含量上,以日龄为X变量拟合出Exponential模型。试验二:唾液的采集和DNA提取方法研究本次研究加入了无伤提取动物DNA方法的探究。首先建立了采集二花脸猪唾液的工具和方法并以此采集二花脸猪的唾液样本。在DNA提取实验中,我们设立了三个对比组(裂解法和碘化钾法、成年公猪和仔猪、唾液和肌肉)来比较DNA提取的浓度和纯净度效果,再通过PCR和测序来验证唾液提取的DNA样本是否为二花脸猪的DNA。研究的结果有:1)根据猪的体型大小不同和唾液采集的难易度,设定了两种唾液采集方法分别为自制海绵采集工具和棉签。对于成年体型较大的猪使用自制的海绵采集工具采集唾液,体型较小的仔猪使用棉签采集工具。2)组织裂解法处理唾液获得的DNA效果比碘化钾法好。3)成年公猪和仔猪的唾液DNA在浓度和纯净度上无明显差异,说明尽管成年公猪唾液含有的杂质较多,但并没有影响提取出的DNA纯净度。4)总体上唾液提取的DNA在纯净度上与肌肉结果无明显差异。5)琼脂糖凝胶检测和测序的结果显示唾液提取的DNA含有二花脸猪的DNA。试验三:二花脸猪ACSL1基因与活体脂肪性状的关联分析为了探究ACSL1基因是否与二花脸猪的活体脂肪性状有关,我们对6月龄左右的二花脸公猪进行活体背膘厚和肌内脂肪含量等数据的测量以及唾液的采集并提取DNA。根据采集的184头二花脸猪的脂肪性状等数据建立三个活体脂肪性状的高低组(背膘厚、肌内脂肪含量、活体背膘厚/肌内脂肪含量),并以此来筛选脂肪性状相关的ACSL1基因启动子区域的SNP位点。在整个群体范围,测序并对比该SNP位点在二花脸猪群体中的等位基因频率。结合遗传系谱记录和脂肪性等数据,运用混合线性模型对脂肪性状和ACSL1基因进行关联分析。结果发现:1)ACSL1基因启动子区有三个突变位点,其中只有c.-33A>G位点在活体背膘厚上存在差异,并且差异度高于0.2。2)关联分析结果显示该位点的AA基因型与GG基因型之间在活体背膘厚上有显著差异(P<0.05),但在其他脂肪性状上无明显差异。综上所述,得出的结论如下:1、综合拟合度与生长日龄拐点和体重拐点等数据,我们得出Bertalanffy模型为二花脸猪的最适体重生长曲线。Guassian模型对二花脸猪活体背膘厚的拟合最好。2、建立了唾液采集的方案和提取动物DNA的方法。3、通过对ACSL1基因启动子区域测序找到c.-33A>G突变位点,并发现该突变位点与二花脸猪活体背膘厚性状显著相关。
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