猪MC4R和ME1基因的多态性及其与背膘厚的关系研究

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脂肪沉积性状是猪的重要经济性状,与猪肉品质及其经济价值紧密联系。猪MC4R基因和ME1基因都是与脂肪沉积有关的基因。黑素皮质素受体4 ( melanocortin 4 receptor, MC4R)是G蛋白耦联受体( G protein coupled receptors, GPCRs)超家族的一个成员,在人和小鼠的体重、能量稳态和采食量的调控中发挥重要作用。苹果酸酶1(ME1)是机体内源性脂肪酸合成的关键酶,可催化苹果酸氧化脱羧生成丙酮酸和CO2,并使NADP+还原成NADPH,而NADPH是脂肪酸合成及其碳链延长的重要辅酶。本文研究了猪MC4R基因和ME1基因的多态性及其与背膘厚的关系,目的在于寻找猪脂肪沉积的分子标记,从而为猪的育种提供一种新的途径和方法。本研究采用PCR-RFLP技术对MC4R基因的298位点错义突变(Asp298Asn)在莱芜猪、大莱二元杂交猪和商品猪中的多态性进行了检测,并对该突变与商品猪背膘厚的关系进行了关联分析。对猪ME1基因5’调控区进行了克隆,并对该区段的多态性及其与商品猪背膘厚的关系进行了分析。结果如下:1.在MC4R基因研究方面,在33头莱芜猪中只检测到11基因型,而在大莱二元杂交猪和商品猪中11、12和22基因型均有分布,且等位基因1的频率均高于等位基因2。商品猪不同基因型个体背膘厚差异显著,22基因型个体均值显著高于12基因型(P <0.01)和11基因型(P <0.05)个体均值。MC4R基因Asp298Asn错义突变与商品猪的背膘厚有关,可以作为以西方猪种为杂交亲本的商品猪背膘厚的分子标记。2.克隆得到猪ME1 5’调控区约1.2kb序列,用PCR-RFLP和PCR-SSCP方法对3个突变位点-486、-283及-1068进行了多态性检测。-486位点共检测6个猪群体(野猪、莱芜猪、杜洛克、大莱二元杂交猪及商品杂交猪)的多态性分布,结果只检测到BB和AB两种基因型,B等位基因为优势等位基因,6个群体在该突变位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。-283位点没有检测到多态性。-1068位点,除野猪、莱芜猪没有检测到AA基因型外,杜洛克、大白猪及商品猪中3种基因型均有分布,5个猪群的基因型频率和基因频率分布存在差异,莱芜猪BB基因型频率最高为0.769,而野猪BB基因型频率最低为0.111。3.关联分析表明,ME1-486位点商品猪及大莱二元杂交猪不同基因型个体背膘厚差异不显著(P=0.1402>0.05),但BB型个体背膘厚的最小二乘均值低于AB型个体(MBB=2.898±0.048, MAB=3.070±0.111),B等位基因趋向于一种有利等位基因,可能有降低背膘厚的效应。-1068位点,商品猪不同基因型个体背膘厚差异显著(P=0.025 <0.05),说明该位点的多态性与背膘厚具有显著相关,等位基因A具有降低背膘厚的效应。本研究的结果可为深入探讨猪脂肪沉积的原理,改善猪肉品质提供参考。
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