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我们的前期工作已经证明了在小鼠受精卵早期发育信号传导过程中,蛋白激酶A(PKA)和蛋白激酶C(PKC)是调节有丝分裂促进因子(MPF)活性的重要物质。当小鼠受精卵进入第一次细胞周期的M期时,cAMP浓度和PKA活性都降低,而MPF活性升高。
诸多数据显示MPF在小鼠受精卵早期发育中处于中心地位。首先,MPF,Plk1和Cdc25形成一个正反馈通路,其次;有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶(Mos)活性随着MPF活性变化,且形成Mos-MEK-MAPK级联系统;再次,Myt1和Wee1激酶通过磷酸化Cdc2上Thr14和Tyr15位点而抑制MPF的活性,但是Plk1能够可通过磷酸化Myt1上的特定位点进而抑制Myt1的活性。一旦MPF活性达到最大值,APC通过对CyclinB的降解而使MPF活性下降。在M期后期,因为PP2A的作用,Cdc25、Mos、MEK、MAPK的活性开始下降。这时,cAMP浓度和PKA活性重新开始升高,且小鼠受精卵一分为二,由此我们认为,cAMP就如同扳机一样触发了小鼠受精卵的早期发育过程。
蛋白相互作用的网络在本质上是动态的,蛋白间的一系列动态作用关系,可转化成一系列描述系统的时空进化的数学方程,方程的类型取决于所要处理的生物学问题。对于细胞周期控制系统,适合应用常微分方程,在数学上来说,应用微分方程知识捕获了我们关于蛋白合成和分解,磷酸化和去磷酸化的直觉认识,且这些方程允许我们计算每个蛋白的浓度变化。对于不同的反应类型,我们应用不同的速率法则,从而可以得到不同的微分方程:
Gepasi(generalpathwaysimulator),通用通路模拟器。它是一个用来模拟生物化学系统的软件包。包括模型的参数估算;优化模型功能;代谢物控制分析和线性稳定性分析。本文正是用Gepasi建立数学模型,初步模拟了小鼠受精卵一细胞期发育过程中的信号传导。