世界经济全球化以及信息和通讯技术的迅猛发展企业生存的环境越来越复杂,竞争越来越激烈,给企业的生存和发展提出了巨大的挑战。为了维持自己的核心竞争能力,企业开始寻求与其他企业的合作创新之路,甚至包括与竞争对手。合作创新起源于70年代中后期,之后在发达国家迅速发展,目前美国仅在信息技术、生物技术、新材料等有关高新技术领域建立的合作创新组织就多达4500多个,合作创新组织己成为发达国家新的技术创新组织形式。同时,企业合作创新受到了越来越多的学者的广泛关注。在国内外的研究中,关于企业各方面的绩效评估的文章很多,包括技术创新,企业绩效,企业员工绩效,领导绩效,生产绩效,环保绩效等等。近年来技术创新绩效成为研究的热点,但是企业合作创新绩效的相关研究却很贫乏。尤其是在国内,相关的企业合作创新指标体系都是依据自己的研究内容或应用的领域特点建立起来的,对指标的选取,缺乏统一的标准,它们既有相似的部分,又存在很大差异。在这样的背景之下,本文首创性的提出建立客观、完备的企业合作创新绩效评价体系。首先,在总结前人研究的基础之上提取有关合作创新的指标,再根据建立指标体系的八项原则去重取精,依据企业合作创新的特点和目的将指标划分为三个方面,即表现技术创新的方面,表现合作沟通能力的方面,以及表现社会影响力的社会效益方面。从而建立科学完整的企业合作创新绩效评价指标。其次,将灰色模型运用到企业合作创新绩效评价领域作为数据分析处理的工具。根据反映企业合作创新绩效的指标和灰色模型对数据处理的要求,设计量表和调查问卷,通过专家打分法和小规模访谈获取符合行业特征的指标权重,评价灰类和两个目标企业的数据。再次,利用基于端点的三角白化权函数的灰色聚类方法处理两个目标企业的数据,分析数据处理结果,寻找影响企业合作创新的瓶颈,为企业未来合作创新战略提供策略。最后,通过以上的研究总结研究新创建的体系和灰色模型在实践领域中的应用能力,挖掘它们在实践运用中的优势、局限性,以及未来的发展趋向。