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鲽形目鱼类经过上亿年的的演替，形成今天几乎遍及全球且种类纷繁的生物群类。世界上有记载的比目鱼类在570种以上，隶属于14科、123属(Nelson,1994)。根据李思忠1995年的记载，我国有134种，隶属8科、50属，广布于黄渤海与东海、南海水域。本论文利用线粒体DNA中的16S rRNA基因片段、细胞色素B基因(cytochrome b,cyt b)和控制区序列(control region)对黄海常见的10余种鲽形目鱼类进行了分类及其系统进化进行了初步探讨，并对鲽形目鱼类线粒体控制区序列特征，进行了简单描述。 本论文利用线粒体16S rRNA基因部分序列对产自黄海的高眼鲽、虫鲽、石鲽、亚洲油鲽、角木叶鲽、尖吻黄盖鲽、圆斑星鲽、褐牙鲆、桂皮斑鲆、带纹条鳎、半滑舌鳎以及来自欧洲比利时的欧洲黄盖鲽，计12种鱼类的分类和系统发生关系进行了研究。在NJ分子系统树中，高眼鲽、虫鲽、石鲽、亚洲油鲽、尖吻黄盖鲽、欧洲黄盖鲽和六种鲽科鱼类，显示关系比较密切，高眼鲽和欧洲黄盖鲽地理位置相差遥远却显示很近的亲缘关系，圆斑星鲽单独占据一枝，而角木叶鲽与其他七种鲽类的遗传距离比较远，在分子系统树上与褐牙鲆聚类；褐牙鲆与桂皮斑鲆分属牙鲆科的不同亚群被证实；鳎类较其他鱼类特化，舌鳎科为鲽形目中最特化的一个科，与传统的分类观点相一致。ME树和NJ系统树的结果一致，在鲽科鱼类之间的关系上MP树显示不同的结果。 利用细胞色素B基因部分序列对高眼鲽、虫鲽、石鲽、亚洲油鲽、角木叶鲽、尖吻黄盖鲽、欧洲黄盖鲽、圆斑星鲽、褐牙鲆、桂皮斑鲆和带纹条鳎11种鱼类分析的结果与利用线粒体16S rRNA基因片段所得的结果相比略有不同，在鲽科鱼类内部的相互关系上，亚洲油鲽、圆斑星鲽和虫鲽聚类，高眼鲽、石鲽、欧洲黄盖鲽和尖吻黄盖鲽聚类；角木叶鲽、褐牙鲆和桂皮斑鲆间显示较近的亲缘关系。而MP树中高眼鲽、石鲽、欧洲黄盖鲽和尖吻黄盖鲽聚类，亚洲黄海蜂形目鱼类系统发生与分子进化的初步研究油蝶和圆斑星蝶聚类，虫蝶、角木叶蝶、桂皮斑鲜和带纹条绢四种鱼类聚类。根据细胞色素B氨基酸序列得到的系统树中与细胞色素B碱基序列的分析结果相比，也是在蝶科鱼类内部的相互关系上分歧比较大。但ME树、NJ树和MP树显示的结果一致性比较大。 利用控制区序列对高眼蝶、石蝶、欧洲黄盖蝶、亚洲油蝶、角木叶蝶、尖吻黄盖蝶和圆斑星蝶七种蝶科鱼类的分类关系进行了分析，结果与上两个片断分析的结果也不一致，但角木叶蝶始终显示最为特化。 总的来看，在分类关系上，高眼赚、虫蝶、石蝶、亚洲油蝶、尖吻黄盖蝶和欧洲黄盖蝶六种媒科鱼类之间的关系比较近，圆斑星蝶与以上六种鱼类的关系较远，而角木叶蝶与其他蝶类相比，最为特化。褐牙解和桂皮斑解虽然同属一科，两者的亲缘关系较远.本文采用三种分子系统树:邻接法伽eighbor-J。谊玩g，N刀、最小进化法(Mha咖切叮Evolution， ME)和最大简约法(Maxim切In Pars油。ny，N田)分子系统树，NJ树和ME树的结果比较一致，但Mp的结果与上两者有不同，尤其是在几种蝶科鱼类的相互关系上。显示这三种分子系统树在低阶分类界元的应用中应慎重考虑。 根据其他学者的研究，对控制区序列中的保守块(co~d sequence block，CSB)进行了分析，在鲜形目鱼类(参用了奸类和组类的数据)线粒体控制区的5，端发现了有两个保守块(CMs’d和CsB一F)，其序列同其他学者研究结果有一致性，并且通过在G即bar止中搜索，发现分别在16和13个目(或更多)的硬骨鱼类中发现有这两个保守块.同时对鱼类的终止相关序列(tenninalassociated sequenCe，TAS)与扩展终止相关序列(exteni tem血回韶sociatedsequcnce，ETAs)进行了初步探讨，并对扩展终止相关序列的潜在二级结构与其他学者的结果进行了比较分析。