本文以太湖和辽河流域为研究对象，于2011年6月到2012年12月间对太湖进行2次、对辽河流域进行3次浮游动物大规模的采样调查，从浮游动物种类组成、密度、优势种及生物多样性等方面进行了研究，并应用生物多样性指数对水生态基准进行了验证。主要结果如下:　　 1.太湖共鉴定出浮游动物2门75种或变种，其中轮虫55种，占总数的73.33％;其次是枝角类和桡足类，各10种，分别占总数的13.33％。辽河流域共鉴定出2门90种或变种，其中轮虫74种，占总数的82.22％;其次枝角类9种，占总数的10.00％;桡足类7种，占总数的7.78％。　　 2.2011年-2012年，太湖水域浮游动物总密度的变化分别为5.33～1930.67个/L、6.33～1236.00个/L，平均密度分别为326.46个/L、643.64个/L，最大值出现在湖东滨岸区HD4、梅梁湾M7，其中轮虫密度占群落密度的68.72％、8.67％;最小值出现在西南区XN3、梅梁湾M8，其中轮虫密度占群落密度的19％、23.62％。2011年6月、2012年6月及2012年12月，辽河流域浮游动物总密度的变化范围为8.63～2292.06个/L、8.67～718.67个/L、0.30～35.70个/L，平均密度为628.97个/L、168.65个/L、5.37个/L。最大值出现在H6、L7、D2，最小值出现在D2、L8、H2。　　 3.太湖2011年各采样点主要优势种为象鼻溞(Bosmina)、广布中剑水蚤(Mesocyclops leuckarti)、角突网纹溞、螺形龟甲轮虫(Keratella cochlearis)等。2012年各采样点主要优势种为象鼻溞(Bosmina)、广布中剑水蚤(Mesocyclopsleuckarti)、等棘温剑水蚤(Thermocyclops)等。辽河流域2011年各采样点主要优势种萼花臂尾轮虫(Brachionus calyciflorus)、角突臂尾轮虫(B.angularis)、螺形龟甲轮虫、曲腿龟甲轮虫(K.valga)等。2012年各采样点主要优势种为螺形龟甲轮虫、萼花臂尾轮虫、转轮虫(Rotaria rotatoria)等。　　 4.太湖2011年多样性指数、丰富度指数和均匀度指数的平均值分别为2.24、2.14、0.65;2012年各指数平均值分别为3.07、3.20、0.70;辽河流域2011年各指数平均值分别为3.36、5.33、0.79，2012年各指数平均值分别为3.30、4.26、0.81。太湖符合生物多样性指数H水生态基准的采样点从2011年1个上升到2012年7个，辽河符合水生态基准的采样点从2011年40％上升到48％。太湖和辽河流域的生物多样性指数H水生态基准的原推荐值(3.44、3.41)适合相应目标水域。