烟草系统在国民经济中起着十分重要的作用：2012年烟草行业实现工商税利8649.39亿元,其中烟草工业实现税利5999.53亿元,占2012年全国财政总收入117210亿元的5.12%,因为我国烟草行业长期以来处于垄断地位,所以才能获得如此高额的利润。JS中烟工业有限责任公司作为烟草系统的成员之一,目前的绩效评价体系以经济运行、国有资产经营管理和创新能力等三部分指标为主要内容,覆盖了烟草工业企业生产运营的主要方面。但是在指标的应用方面,存在着税利不分以及偏重财务指标等不足,不利于公司竞争力的提升,也不利于公司的综合发展。本文首先回顾了企业经营绩效评价体系的各方理论成果,介绍了国内外在国有企业经营绩效评价方面的实践经验；而后结合国内外烟草工业企业的实际情况和发展趋势,对JS中烟工业有限责任公司的经营绩效评价体系进行分析,指出现有体系的不足,然后运用平衡计分卡基本原理,进而对绩效考核指标进行筛选,再运用层次分析法、特征向量法对考核指标赋予权重,构建了一套适合烟草工业企业发展要求的绩效评价体系；最后以JS中烟工业有限责任公司为例,结合2003年成立以来历年经营数据,对新绩效评价体系进行了数据验证分析。通过数据验证分析,得出以下结论：该经营绩效评价体系与JS中烟工业有限责任公司的经营目标高度匹配,有助于克服现行评价体系过于看重财务指标的缺陷,使指标之间相互联系、相互促进,对于规范JS中烟工业有限责任公司的经营管理方向有着实际的导向作用。