并购估值一直是并购活动中非常重要的一个环节，估值的准确与否直接影响了并购的成功性以及之后企业并购绩效。本文通过理论分析和模型推导，证明在目前并购中，尤其是技术并购中，价值估值方法在准确性方面存在或多或少的问题，评估过程中参数的选择具有较大的主观性，这种主观性就使得利益相关者有了一定的操纵空间。而目前国内资本市场属于新兴市场，相关保护制度也还在调整和完善中，股东利益受到侵害的现象常有发生，所以从保护股东利益角度出发来分析技术并购估值具有重大意义。本文所分析的问题，国内尚无相关学者进行研究，在理论方面具有一定的开拓性，同时该问题也是实务界所关注的重点内容，本文也进行了一定的探索。本文的研究方法包括问卷调查分析和实证分析。问卷调研，共收回有效问卷113份。本文通过这些问卷样本数据了解目前国内技术并购、并购估值等内容的现状。统计结果如下，技术并购较多发生在企业本身为科技企业的样本中；在估值方法选择上，较多选择收益法；但是国企在并购中倾向成本法，民营企业采用收益法较多；技术并购中，较多的是溢价收购；对估值影响较大的无形资产的价值。本文然后从数据库及公司公告收集到185个技术并购样本，用这些样本来研究技术并购估值和股东利益保护之间的关系。文章从股东利益保护角度进行研究，开拓性地将技术并购估值问题同我国特色的市场环境以及企业特性相结合起来进行分析。实证分析后，本文得出了以下结论：主并方投资者保护水平与估值水平负相关，且这种关系在技术并购有所减弱；在非技术并购中，目标方的市场化水平与估值水平负相关，但是在技术并购中，这种关系不显著；企业的资金充裕度与估值水平正相关。