FK506结合蛋白(FKBPs，FK506-binding proteins)是免疫抑制剂FK506以及雷帕霉素的药物受体蛋白，它是一个大的蛋白家族，在多种生物体中已经发现。它在生物体中参与多种活动，如有些FKBPs可以调节激素信号转导通路，在种子的萌发，植株的生长等过程中起到重要的作用。还有一些FKBPs被发现在非生物胁迫以及植物抗逆性中起到重要作用，所以目前对植物体中FKBPs的研究已成为一个热点。本研究采用生物信息学与分子生物学相结合的手段对玉米全因组的FKBPs基因进行进化和表达分析，获得如下主要结果：　　 1．运用生物信息学的多种软件进行搜索和比对，在玉米全基因组中共获得了30个FKBPs蛋白的基因。通过对这30个FKBPs基因的序列分析可将其分为单结合域基因和多结合域基因两大类。基因复制分析发现有18个基因是来源于基因复制，占总数的一半以上，这说明基因复制可能是造成玉米中FKBPs基因数目多于其他生物的原因。　　 2．通过对玉米FKBPs基因进行染色体物理位置分析，结果显示这30个基因分散的分布在玉米的十条染色体上，1号和5号染色体上最多，各有7个基因；1、4、5三条染色体各有一个基因簇出现，这与拟南芥无基因簇有明显不同。　　 3．通过构建系统进化树分析了FKBPs基因的进化关系，结果显示这些基因主要分为两大分枝，两个分枝成员的相似性较高，而与水稻的FKBPs基因进行比较分析发现玉米与水稻的基因具有高度同源性，但在数目及进化关系上又存在一定的区别。这表明玉米中FKBP基因的进化相对较为复杂。　　 4．基序分析显示玉米FKBP基因的结构比较复杂，有的基因基序较长有将近600个氨基酸长度，包含有10几种不同的基序，而有的基因基序较短长度还不到100，最短的只包含3种基序，Motif16，Motif17，Motif18以及Motif19，这几种基序只在少数的基因中出现，但基本所有的基因都包含Motif1以及Motif4这两种基序，说明这两种基序在亲免蛋白的免疫机制中可能发挥着特殊的作用。　　 5．通过半定量RT-PCR技术，分析了玉米30个FKBPs基因在根、茎、叶的表达模式，结果显示30个FKBPs在各个组织中都有表达，而且不同的基因在不同的组织中表达强度有差异。ZmFKBP12a，ZmFKBP18-20在叶片中表达较强：ZmFKBP16-2b和ZmFKBP16-3则在根中表达较强，而ZmFKBP17-2a表现出根的特异性表达，这种表达模式为深入研究FKBPs基因的作用和功能提供了重要依据。