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禽流感是由正粘病毒科、流感病毒属A型流感病毒引起的一种禽类传染病,可分为非致病性禽流感(NPAI)、低致病性禽流感(LPAI)和高致病性禽流感(HPAI)3种。在我国,低致病性禽流感以H9N2亚型为主型。禽流感的广泛流行给家禽养殖业造成巨大经济损失。近年来的研究表明,禽流感正在逐步突破感染哺乳动物的屏障,特别是低致病H9N2病毒的一些特异性变异,使得其对人和哺乳动物的潜在威胁越来越大。疫苗接种是当前我国采取的最普遍最有效的防控手段,禽流感病毒在疫苗选择压力下正在不断发生重组、变异。对禽流感的流行情况进行实时监测,并搞清其遗传进化特点,对于及时制定科学的防控策略具有重要意义。本论文在进行华东地区禽流感常规流行病学调查的基础上,重点对2010-2012年分离的44个H9N2代表株的遗传进化情况进行系统分析,并筛选出候选疫苗株进行保护效果评价。为搞清各亚型禽流感的流行情况,我们选取了华东地区某大型活禽市场进行定点监测。从2011年7月到2012年6月,每月从该活禽市场采集约200份家禽泄殖腔棉拭子进行病毒分离鉴定。结果表明,一年间,共采集样品2326份,分离到阳性样品374份,分离率为16.08%。当前流行的禽流感以低致病的H3、H4、H6、H11等为主,且多从水禽(鸭、鹅)分离,鸡群分离率低。冬季较其他时期分离率高。选取2010-2012年间的分离的44株H9N2代表株进行全基因测序,并绘制各基因片段系统发生树进行遗传进化分析。结果表明,这期间华东地区流行的H9N2外部基因和内部基因均发生较大变化,逐渐形成一个比较统一的不同于该地区经典株F/98的新基因型V。其中HA基因形成新的分支HK/Y280/97-like,与Ck/SH/F/98的核苷酸及推导的氨基酸序列同源率分别仅为88.8%-92.4%和90.3%-93.8%,很多抗原位点发生变化,受体结合位点226位均为L。内部基因中M基因为HK/G1/97-like,其它基因仍为SH/F/98-like.筛选疫苗候选株是流行病学调查工作的重要目标之一。本研究在H9N2病毒遗传进化分析的基础上进一步进行抗原性分析和生物学特性的测定,筛选出H9N2疫苗候选株WJ57。WJ57于2012年02月分离于江苏常州,HA效价10-11,EIDso值为9.17,具有很好的繁殖能力,无传染性支气管炎病毒混合感染,热稳定,且与当前流行株高度同源。交叉免疫攻毒保护试验表明,WJ57灭活苗免疫鸡群一次抗体水平能达到9以上,比商品化F/98疫苗高2个滴度以上；整体保护率为93.3%,也比F/98疫苗的80%要高。综上可知,WJ57是一个良好的候选疫苗株。