儿童肿瘤多组学大数据分析平台

来源 :华东师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:baliver110
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肿瘤是成人和儿童死亡的主要原因,但相对而言,大多数儿童肿瘤是比较罕见的疾病。Therapeutically Applicable Research To Generate Effective Treatments(TARGET)数据库已经释放了多种儿童肿瘤的多组学数据以及临床数据。这些数据为挖掘儿童肿瘤发展相关分子机制创造了条件。然而,由于组学数据具有存储量大,维度高等特点,对无生物信息学背景的研究人员而言门槛较高且难以使用,极大地限制了多组学数据在儿童肿瘤中的应用。此外,目前很少有专门针对儿童肿瘤数据分析的平台,为无生物信息科研背景或编程能力薄弱的研究人员使用。因此,本课题开发了儿童肿瘤多组学大数据分析平台,通过Web Server的形式进行展示。基于来自GEO、TARGET、SRA数据库中的多种儿童肿瘤的不同组学数据,提供了多种定制化的分析功能,包括基因基本信息查询、基因差异表达分析、甲基化差异分析、多组学关联分析、相似基因计算检测、患者生存分析、肿瘤免疫细胞浸润程度分析。本平台针对儿童肿瘤数据进行了多方位的分析,为相关的研究人员提供全面、简洁的数据挖掘功能,致力于将多组学应用于儿童肿瘤相关的基础研究和临床研究中并推动其发展,显著地降低了复杂的基因组数据与研究者之间的障碍。
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