在股票市场中,对不同市场板块之间关系的研究近年来是一个备受关注的问题。从2009年10月30日开市到现在一年多的时间内,我国创业板市场规模取得了突飞猛进的发展。虽然创业板市场与主板市场中上市企业的类型与规模不同,但是由于两板市场在同样的宏观经济背景中运行,并且创业板市场与主板市场都是我国多层次资本市场重要组成部分,两者相互竞争,相互补充,因此,两板市场的运行不可避免地会产生相互影响。为了有效发挥两板市场各自的经济功能,并对两板市场实施有效的监管,就必须对两板市场关系的内在特征有一个全面的认识和把握。因此,眼前对我国创业板市场与主板市场关系的实证研究也就显得非常有意义。由于我国创业板市场刚刚运行不久,创业板指数推出尚不足一年,进行实证研究所需要的创业板指数有关数据资料非常有限,因此,目前国内学者对于这个新兴市场的实证研究十分薄弱,有关我国创业板市场与主板市场关系的实证研究成果更是极其少见。　　 本文采用从2010年6月1日我国创业板指数推出后到2011年3月初这段时间的创业板指数与深圳综合指数的最新数据,对我国创业板市场与主板市场的关系进行一次尝试性的实证研究。首先利用创业板指数与深圳综合指数日收益率之间的协整关系建立双变量EC—EGARCH模型,辅以格兰杰因果关系检验,并结合非流动性综合测度指标对我国创业板市场与主板市场波动关系与冲击效应进行了论证；其次,在上述论证结果的基础之上,建立VAR模型,利用脉冲函数与方差分解来对两板市场之间的动态关系作进一步论证；最后,通过协整理论检验两板市场之间的长期均衡关系,并在此基础上建立ECM模型来分析两板市场在这种长期均衡关系中对短期波动调整的实现过程。通过上述对我国创业板市场与主板市场关系的综合全面论证,得到如下结论:两板市场对波动性的影响具有不对称性,主板市场波动引致创业板市场波动:两板市场的流动性存在双向溢出效应,主板市场的流动性要强于创业板市场；两板市场价格指数存在长期均衡关系。并在上述结论的基础上,提出了相应的针对市场监管方面的政策建议。由于有关研究数据资料缺乏,文者研究水平有限,本文的研究结论有待其他研究人员采用更丰富的数据和更好的理论与模型对两板市场关系作进一步考证。