【摘 要】
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目的:肉瘤样肾细胞癌是肾癌的一种特殊去分化形式,预后极差,有关的分子机制研究尚不完善。肾细胞癌本身的预后差异极大,需要预后模型将病人分层从而指导精准治疗。方法:从TCGA数据库下载伴有肉瘤样分化的透明细胞肾细胞癌(sRCC)和作为对照的不伴有肉瘤样分化的透明细胞肾细胞癌(ccRCC)数据,使用倾向得分匹配两组病例,然后进行转录组学等比较差异。使用分析得到的肉瘤样分化相关基因,通过Lasso-COX
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目的:肉瘤样肾细胞癌是肾癌的一种特殊去分化形式,预后极差,有关的分子机制研究尚不完善。肾细胞癌本身的预后差异极大,需要预后模型将病人分层从而指导精准治疗。方法:从TCGA数据库下载伴有肉瘤样分化的透明细胞肾细胞癌(sRCC)和作为对照的不伴有肉瘤样分化的透明细胞肾细胞癌(ccRCC)数据,使用倾向得分匹配两组病例,然后进行转录组学等比较差异。使用分析得到的肉瘤样分化相关基因,通过Lasso-COX回归构建预后分层模型,并进行验证。结果:从454例肾透明细胞癌中鉴定出45例伴有肉瘤样肾癌,倾向得分匹配后有21对病例数据。差异分析了 sRCC中上调和下调的转录组学,并进行了功能富集。发现了 sRCC中18个免疫检查点基因高表达。使用肉瘤样分化相关基因进行了非负矩阵分解无监督聚类,将454例病例较好的分成4类。将肉瘤样分化相关基因降维后构建了预后分层模型和诺模图,诺模图的一年受试者工作曲线下面积可达0.875。结论:详细的比较了 sRCC和ccRCC多组学差异,利用sRCC相关基因开发的预测模型可以很好地预测伴/不伴肉瘤样分化的透明细胞肾细胞癌患者的预后情况。
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