我国上市公司股权再融资方式主要是增发和配股两种方式。本文首先分别从非流通股股东利益和流通股股东利益的角度分析哪些是影响股权再融资方式选择的因素。其次以1999年至2004年之间成功实施增发或配股，在深圳和上海证券交易所上市的非金融类A股上市公司作为样本进行实证研究，进而检验影响股权再融资方式选择的具体因素。实证检验的结果表明：第一，基于非流通股股东利益的因素比基于流通股股东利益的因素对股权再融资方式选择的影响更大；第二，预期利润越小、预期再融资净额越大、预期股票差价越大，上市公司越倾向于选择增发方式进行股权再融资；预期利润越大、预期再融资净额越小、预期股票差价越小，上市公司越倾向于选择配股方式进行股权再融资；第三，非流通股比例低的组有关股东利益的因素对股权再融资方式选择的影响程度显著高于非流通股比例高的组。