圆斑星鲽MSTN和MHC HB基因的克隆与表达分析

来源 :辽宁师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:onepieceeee
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圆斑星鲽(Verasper variegatus),俗称花斑宝、花瓶片,自然分布于我国黄渤海和东海、日本北海道以南至九州沿海。其肉质鲜美,营养丰富,经济价值高,深受广大消费者与养殖户的欢迎,为一种非常适合北方养殖的水产鱼类。   本实验采用同源克隆和基因组步移法,克隆了圆斑星鲽肌肉生长抑制素基因(MSTN)的部分序列。MSTN基因长2992bp,包括873bp的5’侧翼区和1086 bp的编码区;编码362个氨基酸,包含三个结构域,分别为前22个氨基酸组成的信号肽,第275与278位氨基酸之间的蛋白酶加工位点RVRR及C端活性区的7个保守的半胱氨酸残基;启动子中含有2个TATAbox,1个CAATbox和一些转录反应调控元件(AP、Sp1、MyoD、CTF);多序列比对表明,圆斑星鲽MSTN部分氨基酸序列与其他物种具有较高的相似度;系统进化树表明,所有硬骨鱼类的MSTN氨基酸序列聚合为一簇:而其他高等脊椎动物聚为另一支。   利用cDNA末端快速扩增(RACE)法,克隆了圆斑星鲽的主要组织相容性复合物二型基因(MHC IIB)的全长cDNA序列。MHC IIB基因全长为1144bp,包括Top的5’UTR,450bp的3’UTR和687bp的开放阅读框,共编码228个氨基酸,包含信号肽、抗原结合域(β1)、IGC区(β2)、跨膜区和胞质区5个结构域;同源分析表明,圆斑星鲽MHC IIB氨基酸序列与其他物种具有30%~79%的同源性;系统进化树表明,所有硬骨鱼类的MHCIIB氨基酸序列聚为一簇,其中鲽形目的圆斑星鲽与牙鲆聚为1个分支,位于硬骨鱼类分支的基部;软骨鱼类与其他高等脊椎动物聚为一支。MHC IIB基因的表达结果表明,在健康圆斑星鲽血、肾、脾脏、心、皮、肌肉、肝、鳃和脑9种组织中均有表达,肾的表达量最高,肌肉的表达量最低。且排列顺序为:肾>心>脾>鳃>肝>皮肤,脑>血>肌肉。  
其他文献
学位
石磺为软体动物门腹足纲的雌雄同体动物,我国华东沿海分布有瘤背石磺(Onchidium struma)、平疣桑椹石磺(Platevindex mortoni)、里氏拟石磺(Paraoncidium reevesii)、紫色疣