为临床定义的疾病样本发现分子层面的异质性(疾病亚型)对于理解复杂疾病的病理和开展有效治疗都十分关键。最近，人们认识到功能相关的基因组成功能模块协调起来共同决定了表型。认识疾病的模块化机理将有助于分析疾病的亚型 本研究把富集了高变异基因的、从生物学过程和细胞定位两方面限制的一组基因定义为可能的疾病相关功能模块。我们首先利用两套癌症芯片数据来测试模块的样本分类能力，发现疾病功能模块能够得到较好的样本分类；其次，我们利用鉴定的疾病相关功能模块来分析弥漫性大B细胞淋巴瘤的亚型。我们通过生存分析表明，利用一个疾病相关功能模块(细胞对胁迫的应答)区分出的两组病人之间存在十分不同的五年生存率(65％versus14％)，生存率之间显著不同(p＜0.007)，提示这两组病人有可能是遗传机制完全不同的两类弥漫性大B细胞淋巴瘤亚型。我们还通过Cox风险比例模型从该模块中进一步找到了4个基因，构造了通过这4个基因的表达值预测弥漫性大B细胞淋巴瘤病人生存时间的计算模型。 这种模块化的疾病亚型分析方法有助于分析复杂疾病的亚型和理解人类疾病的模块化机理。