三七种植土壤细菌的群落结构多样性及动态变化

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三七为多年生宿根传统药材,具有巨大的药用和经济价值;但由于其生境的特殊性,三七常常受到多种病害的侵袭;其中免耕和化学农药及化学肥料的施用等措施所致的土壤微生失衡是导致病害频繁发生的重要因素之一。细菌作为土壤微生物中的一个重要类群,亦在三七健康与发病中发挥着重要的作用。因此,研究三七种植土壤细菌群落结构及变化,发现病原细菌和有益的活性细菌,对于三七细菌性病害的发生和预防具有重要的指导意义。论文采用MiSeq高通量测序技术,对采自昆明市石林县长湖镇和红河州弥勒市虹溪镇的三七种植地土壤细菌的多样性进行了分析。石林三七种植地土样中细菌分布于40门,104纲,204目,389科,746属(其中包含未分类单元);虹溪三七种植土样中细菌分布于39门,102纲,198目,371科,716属(其中包含未分类单元)。总体来说,石林三七种植地中细菌的多样性较好于虹溪地。在门水平上,两三七种植地土壤中的优势类群以及优势类群的比重基本相同。在目水平上,石林、虹溪两种植地表现出较大的群落差异,Rhizobiales、Gemmatimonadales、Acidobacteriales、Xanthomonad、Burkholderiales为两地共同的优势目,Xanthomonadeles、Rhizobiales、Acidobacteriales、Burkholderiales在虹溪种植地的相对丰度高于石林种植地,Gemmatimonadales、Sphingomonadales、Micrococcales、Sphingobacteriales在石林种植地的相对丰度均明显高于虹溪种植地。石林三七种植地从移栽到第二年的11月份,其细菌多样性总体呈现出随种植时间增长而降低的趋势。虹溪三七种植地在移栽的第一年至第二年5月份,其细菌多样性均无明显变化,而到第二年的8月份至11月份,其细菌多样性指数呈现出略增加的趋势,总体则表现为随种植时间的增长其土壤细菌多样性增加。采用平板对峙法和发酵液稀释扩散法对分离的三七种植土壤细菌进行抗三七主要病原真菌的活性筛选,共得到212株拮抗菌株。其中,有86株对一种病原真菌表现出活性;对两种致病菌表现出拮抗活性的有95株;同时对三种病原真菌具有拮抗活性的有31株,占总活性菌的14.6%。菌株PH10001、PH10006在平板对峙培养中和在发酵液共培养实验中对三种三七的主要病原菌Fusarium oxysporum、F.solani、F.flocciferum均表现出很强的拮抗活性,是可用于三七病害的生物防治。活性细菌多样性分析结果表明在两样点中,拮抗菌株主要集中在芽孢杆菌属(Bacillus)和假单胞菌属(Pseudomonas)。在赖氏菌属(Leifsonia)、微球菌属(Micrococcus)、红球菌属(Rhodococcus)、地杆菌属(Terrabacter)、北里孢菌属(Kitasatospora)、迪茨氏菌属(Dietzia)、鞘氨醇杆菌属(Sphingobacterium)、噬几丁质菌属(Chitinophaga)等属也少量分离得到。选用6种三七田间常施农药,评估了其对活性细菌菌株生长的影响。其中,农药福美双对拮抗菌株的生长普遍存在影响,检测福美双在不同浓度下对6株拮抗菌株的影响,发现在浓度为10μg/ml-400μg/ml时对菌株PH10001、PH10002、PH10003、PH10012、PH10032的生长菌均有抑制性作用。这些结果表明,杀真菌的农药对土壤细菌也具有很大的影响。
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