宁夏地区犊牛腹泻分子病毒学调查及犊牛粪便病毒宏基因组学初步分析

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犊牛腹泻是犊牛在诸多因素的影响下,出现消化不良、腹泻、脱水、消瘦等临床特征的消化道疾病,严重且持久的腹泻会导致犊牛生长发育迟缓、死亡率增加。该病是犊牛的常见病、多发病,也是牛场经济损失的主要原因之一。犊牛腹泻分为感染性腹泻和非感染性腹泻,感染性腹泻由病毒、细菌、寄生虫等致病性病原微生物引起,非感染性腹泻多由营养、应激、环境卫生等引发。牛病毒性腹泻病毒(BVDV)、牛轮状病毒(BRV)、牛冠状病毒(BCoV)是常见的引发犊牛腹泻的病毒,而牛星状病毒(BAstV)、牛凸隆病毒(BToV)、牛嵴病毒(BKoV)、牛细小病毒(BPV)、牛诺如病毒(BNoV)等也逐渐被关注。为快速检测BVDV、BRV、BCoV、BAstV、BToV、BKoV引发的犊牛腹泻病例,针对6种病毒的保守区域设计引物,建立了可同时检测6种病毒的多重PCR检测方法,该方法特异性、敏感性良好,可用于检测临床样品。为具体了解宁夏地区犊牛病毒性腹泻的流行病学状况,通过本试验构建好的多重PCR检测方法和已报道的单一 PCR检测方法,对犊牛粪便进行BVDV、BRV、BCoV、BAstV、BToV、BKoV、BNoV、BPV的分子生物学检测。结果表明,宁夏地区犊牛粪便中BRV、BCoV、BAstV、BToV、BKoV、BNoV、BPV 的检出率分别为 14.23%、5.69%、14.23%、10.57%、26.02%、4.47%、2.44%,腹泻病毒的感染呈现复杂性、多样性。遗传进化分析阳性样品与NCBI中的参考毒株核酸序列一致性高,均在所属病毒群分支上,进一步表明宁夏地区犊牛群中流行 A 群 BRV、BCoV、BAstV、BToV、BKoV、BNoVGⅢ.2、BPV1。为了解宁夏地区犊牛粪便中病毒组成状况,采集6月龄以内犊牛的粪便,利用病毒宏基因组学技术分别对3份健康组、3份腹泻组混合样品进行检测。测序结果注释到小RNA病毒科、星状病毒科、小双RNA病毒科、杯状病毒科、托巴套氏病毒科、呼肠孤病毒科、冠状病毒科等26个病毒科;注释到与犊牛腹泻有关的病毒属有博匹韦病毒属、肠道病毒属、嵴病毒属、匈牙利病毒属、纽布病毒属、诺如病毒属、小双RNA病毒属、哺乳动物星状病毒属、轮状病毒属、凸隆病毒属、β冠状病毒属、瘟病毒属。犊牛粪样病毒宏基因组学结果表明,宁夏地区犊牛粪便中病毒组成复杂、多样,且存在多种与腹泻有关的病毒。本研究分析了宁夏地区犊牛粪便内病毒组成状况,掌握了病毒性腹泻的分子学流行状况,为犊牛病毒性腹泻的病原学诊断提供参考,同时为犊牛腹泻的防控提供数据支撑。
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