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人类免疫缺陷病毒感染导致的艾滋病是威胁全球人类健康的公共卫生问题。根据联合国艾滋病规划署发布的《2013年艾滋病疫情报告》,截至2012年底,全球存活的艾滋病病毒感染者和病人3530万（3220万～3880万）,新发HIV感染者230万人（190万～270万）,艾滋病相关死亡人数160万人（140万～190万）。而南亚和东南亚地区的新发感染人数为27万（16万～44万）,死亡人数为22万（15万～31万）。东南亚地区是亚洲HIV-1感染较为严重的地区之一,而云南省是连通中国和东南亚国家的窗口,也是中国HIV-1基因亚型起源,流行和传播的中心。研究云南省HIV-1的分子流行病学特征,了解它的进化规律或传播规律,对制定防控措施和疫苗生产以及治疗药物的开发等都有重要的指导意义。云南省位于中国的西南边境,与缅甸、老挝和越南3国接壤,由于毗邻全球最大的毒品生产地——“金三角”地区,成为毒品进入中国及其邻国市场的主要通道。随着我国面向东南亚对外开放和边境贸易的发展,云南经各边境口岸的跨境人员也不断增加,随之也带来各种传播性疾病的跨境传播。已有研究对中缅跨境人群HIV-1感染与基因型分布进行了报道,但较少有关于云南省南部口岸跨境人群HIV-1感染情况的研究报告。云南省南部有红河州河口口岸,普洱市勐康口岸,西双版纳州打洛口岸,以及西双版纳国际机场等口岸与东南亚国家直接相通,成为人员跨境和贸易往来繁忙区域。本文选择红河和西双版纳两地州的入境人群进行HIV-1分子流行病学研究,以阐明滇南主要口岸入境人群HIV-1的流行与传播规律。研究对从2003年到2012年募集的326例滇南主要口岸入境HIV-1感染者,采集、提取并储存血浆中病毒RNA,用RT-Nested-PCR方法进行gag-RT区（2.6kb）基因扩增,分为gag （1155bp）、gag-prot （885bp）和RT （1010bp）3个区段,经序列测定拼接后,成功获得163例样本的gag-RT区（2.6kb）序列。采用MEGA6.0软件进行病毒的同源关系分析以确定其基因型,发现HIV-1人群中存在种类多样的HIV-1基因亚型和重组型,包括82例CRF01AE （50.3%）、38例CRF08BC （23.3%）、10例CRF07BC（6.1%）、2例SGR0708 （1.2%）、3例C（1.8%）、2例B（1.2%）和26例URFs（16%）。可见,CRF01AE为主要流行基因型,其次流行的是CRF08BC、 CRF07BC,而“单亚型”B和C退之其后。在已知传播途径的感染者中,以性接触为主要传播途径（90.1%）,可能导致CRF01AE的主要流行。另外,在该人群中存在多种模式的独特重组（URFs）,包括10例B/C、5例CRF08BC/CRF07BC、4例CRF01AE/C、3例CRF01AE/B、2例CRF01AE/CRF08BC、1例C/A1和1例CRF5801B/B/C=Simplot分析发现7种URFs除C/A1、CRF5801B/B/C重组模式只有一种重组结构外,其他的重组模式都有2种或2种以上的重组结构。其中B/C有4种重组结构,CRF08BC/CRF07BC有2种重组结构,CRF01AE/C有4种重组结构,CRF01AE/B有3种重组结构,CRF01AE/CRF08BC有2种重组结构。在这些URFs中,CRF01AE/C、C/A1、 CRFO1AE/CRF08BC和CRF5801B/B/C 4种重组亚型在云南其他地方或中国其他地区还没有过报道,这说明滇南主要口岸入境人群中HIV-1基因亚型分布复杂。综上所述,滇南主要口岸入境人群中存在一定程度的HIV-1流行,且基因亚型种类较多,并存在大量的URFs重组型,入境人群成为HIV-1跨境传播的主要携带者。对滇南主要口岸入境人群的HIV-1分子流行病学特点的阐明,有助于了解云南省HIV-1的传播规律并预测将来的流行态势,对制定HIV-1预防措施,以及疫苗的研制具有重要意义。