基于生物信息学方法的金丝桃素抑制RINm5F胰岛素瘤细胞增殖机制的研究

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胰岛素瘤(insulinoma)又称胰岛β-细胞瘤,是一种常见的胰腺内分泌肿瘤。胰岛素瘤的快速生长导致胰岛素的分泌过量,因此胰岛素瘤患者常表现出低血糖症状,如周期性头痛、倦怠、复视、视力模糊、癫痫、昏迷甚至永久性的神经损伤等。局部分化良好的胰岛素瘤可以通过手术来进行治疗,但是手术对象仅限于良性的胰岛素瘤,对于恶性的、转移的胰岛素瘤,手术治疗的效果并不理想。金丝桃素具有广泛的药理学活性,如抗病毒、抗抑郁、抗炎症及抗肿瘤等,非光照的金丝桃素更优先积累于肿瘤细胞中,在有光存在的条件下,金丝桃素对肿瘤的治疗效果显著提高。这些特性使得金丝桃素被作为一种基于光动力学疗法治疗肿瘤的光敏剂。目前,已有许多采用金丝桃素介导的光动力疗法对肿瘤进行治疗的研究,课题组通过金丝桃素介导的光动力疗法来抑制RINm5F胰岛素瘤细胞的增殖也取得很好的效果。本文对课题组实验获取的转录组测序数据进行综合的生物信息学分析,对金丝桃素介导的光动力疗法对RINm5F胰岛素瘤细胞的作用机制进行了深入研究。首先,通过对样本间进行相关性和聚类分析,本文从宏观上发现金丝桃素介导的光动力疗法处理组与对照组间的基因表达模式发生了较大变化;其次,为了进一步了解样本间基因表达模式所发生的变化,本文对不同时间点的样本筛选表达基因,并对差异表达基因进行GO功能聚类,发现差异表达基因主要富集到了:凋亡、细胞周期负调控、细胞增殖调控、TGF-beta信号通路、氧化应激、血管发育等功能类别;再次,通过对GO功能聚类结果相关的信号通路进行分析,发现金丝桃素介导的光动力疗法主要通过线粒体凋亡途径、JNK信号通路以及ERK信号通路等来抑制RINm5F胰岛素瘤细胞的增殖;然后,通过系统的时间序列分析,本文发现金丝桃素介导的光动力疗法在前期对RINm5F胰岛素瘤细胞增殖有明显的抑制作用,但是在后期抑制作用减弱,RINm5F胰岛素瘤细胞恢复对金丝桃素介导的光动力疗法引起凋亡的抵抗;最后,本文给出了金丝桃素介导的光动力疗法抑制RINm5F胰岛素瘤细胞增殖的作用机制模型。
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