D卫星RNA来源的sRNA在宿主基因沉默和病害发生中的作用研究

来源 :上海师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jiaguwenshurufa
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黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)与其寄生分子D型卫星RNA(D satellite RNA,D-sat RNA)侵染番茄时,可导致番茄植株的程序性死亡。已有研究表明决定D-sat RNA在番茄中发生致死性感染的序列是靠近3′端的第285、290和292位核苷酸,同时突变这三个核苷酸所形成的突变体sat RNA(即Dm-sat RNA)感染番茄时,不引起植株死亡。本实验室尚未发表的研究表明,由RDR6和SGS3参与生成的来自D-sat RNA的s RNA(D-sat RNA-s RNA)的含量与植株死亡病害的产生密切相关,同时其它研究发现来自Y-sat RNA的一个s RNA可通过干扰烟草中镁离子原卟啉螯合酶亚基I(magnesium protoporphyrin chelatase subunit I,CHl I)的剪切和降解,而导致黄叶病的发生。因此本论文探讨了D-sat RNA-s RNA在番茄中是否可沉默宿主基因表达而致病。首先我们利用未被病毒感染的(Mock)和被CMV、CMV/D-sat RNA以及CMV/Dm-sat RNA感染番茄植株样品分别建立了s RNA和m RNA降解组文库,获得了所有D-sat RNA-s RNA的序列及其丰度,并汇集了含上述三个致死性核苷酸的s RNA(D-lethal-vs RNA),结合相应的m RNA降解组文库并利用PAREsnip2软件预测这些vs RNA在D-sat RNA感染的番茄组织中可能靶标的m RNA,预测分析发现番茄的SCC1P2、ERF4、CSF、EIN2、SCMF等五个m RNA可能被D-lethal-vs RNA诱导剪切。根据它们各自的靶标序列,我们进一步构建了融合有表达D-lethal-vs RNA以及含相应靶标序列的e GFP的重组载体,通过烟草瞬时表达技术验证这些vs RNA与其对应靶基因之间的相互作用,同时也在CMV/D-sat RNA和CMV/Dm-sat RNA感染的烟草中表达含相应靶标序列的e GFP载体测试其沉默功能,结果表明SCC1P2可被相应vs RNA靶标剪切,并且其靶标序列具有番茄宿主特异性。为探讨D-sat RNA-s RNA诱导宿主基因剪切和植物病害发生的关系,我们通过由烟草脆裂病毒(Tobacco rattle virus,TRV)改造的病毒诱导的基因沉默(virus-induced gene silencing,VIGS)载体和马铃薯X病毒(Potato Virus X,PVX)表达载体在番茄中分别表达D-sat RNA正负义链,然而植株并没有因为正负义D-sat RNA的表达而出现死亡现象。综上所述,D-lethal-vs RNA可以诱导SCC1P2基因的降解,但是该分子事件和番茄死亡病害发生的关系仍有待进一步阐明。
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