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目的:
1.基因芯片筛选人类卵母细胞从GV期到MII期microRNA谱的变化
2.RT-PCR验证基因芯片中卵母细胞差异表达的microRNA
材料与方法:
收集2008年8月~2010年2月在中山大学附属第一医院生殖中心行ICSI治疗患者的不成熟卵母细胞。
透明质酸和机械法去除颗粒细胞后的卵母细胞放入trizol中-80℃保存。然后进行microRNA芯片实验,检测GV与MII期卵母细胞microRNA的表达情况。GV期与MII期卵母细胞各三组,每组20个。共可获6张芯片的数据。以倍数改变大于1.5倍,t检验中P<0.05的基因定为有差异表达。
应用单细胞荧光定量PCR技术在GV期和MII期验证芯片结果。选择了GV期到MII期表达水平发生上调变化的miR-602,以及发生下调变化的miR-15a和miR-20a。细胞保存条件:透明质酸和机械法去除颗粒细胞,将单个卵母细胞放入溶解液中,-20℃保存。
验证芯片实验结果后,进一步检测来源于以下4组的卵母细胞中miR-15a,miR-20a和miR-602的动态表达情况。
GV组:ICSI患者GV期的卵母细胞;
MI组:ICSI患者MI期的卵母细胞;
MII组:TCM199+1.0iu/mlHCG+10%SPS+5.5 ng/ml FSH培养至MII期的卵母细胞;HMII组:TCM199+1.0iu/mlHCG+10%SPS+2000ng/ml FSH培养至MII期的卵母细胞实验采用以质量单位作为标准进行相对定量的△CT法和有参照基因的2-△△CT法两种方法。统计分析采用t检验与one-way ANOVA方差分析,P<0.05差异有统计学意义,统计软件采用SPSS.13.0。
结果:
在miRNA芯片的分析中,MII组与GV组相比,共有15个microRNA出现差异性表达,其中4个microRNA的表达发生了上调,11个microRNA的表达下调。
单细胞荧光定量PCR的结果中,MII组与GV组相比,hsa-miR-15a的平均倍数改变为0.19,芯片结果中的倍数改变为0.31;hsa-miR-20a的平均倍数改变为0.06,芯片结果中的倍数改变为0.47;hsa-miR-602的平均表达水平上调了5.28倍,而芯片结果中为上调5.01倍。定量PCR数据与芯片数据基本一致。
在miR-15a,miR-20a和miR-602的动态表达情况的研究中,与GV组相比,MI组、MII组和HMII组的hsa-miR-15a相对平均倍数改变分别为:1.380、0.074和0.155,其中MII组、HMII组的平均倍数改变均有显著性差异(P值均小于0.001)。MII组和HMII组两组比较中,HMII组的hsa-miR-15a表达水平高于MII组(P=0.034)。
与GV组相比,MI组、MII组、HMII组的hsa-miR-20a相对平均倍数改变分别为:1.074、0.060和0.320。其中MII组、HMII组的平均倍数改变均有显著性差异(P值分别为小于0.001和0.022)。MII组和HMII两组的比较中,HMII组的hsa-miR-20a表达水平高于MII组(P=0.003)。
hsa-miR-602的表达水平在各组间也是呈动态改变的,其变化趋势与芯片结果相吻合。
与GV组相比,MI组、MII组、HMII组的hsa-miR-602的相对平均倍数改变分别为:0.963、1.033和0.520,各组间平均倍数的改变无显著性。以miR-16为内参的两次实验表明,GV与MII组△CT的差异有统计学意义(P=0.006)。MII与HMII两组的比较中,MII组中hsa-miR-602的表达水平高于HMII组(P<0.010)。
结论:
1.在卵母细胞发育过程中,部分microRNA的表达有显著的变化,并随着减数分裂的不同阶段呈动态改变。
2.培养液中FSH浓度的升高导致microRNA的表达水平发生显著改变。
3.microRNA表达谱芯片可以作为初步筛选目标基因的有效手段。
4.RT-PCR技术可以成功运用于单个卵母细胞microRNA表达水平的研究。