水稻细菌性条斑病菌中群体感应信号途径中三个相关基因的功能分析

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水稻黄单胞菌(Xanthomonas oryzae)包括两个致病变种,分别是水稻白叶枯病菌(X. oryzae pv. oryzae、简称Xoo)和水稻细菌性条斑病菌(X. oryzae pv. oryzicola,简称Xoc),二者分别在水稻(Oryza sativa)上引起白叶枯病和细菌性条斑病。目前,细菌性条斑病已严重威胁到热带和亚热带地区的水稻种植。依赖可扩散信号分子(diffusible signal factor, DSF)的群体感应(Quorum sensing, QS)系统是黄单胞属细菌生物学功能全局性调控网络的重要组成部分,在群体水平上调控病原菌的毒性因子表达、生物膜形成等重要生物学功能。目前已有研究证明,DSF信号分子合成和传导与rpf基因簇及全局性调控转录因子Clp密切相关,在野油菜黄单胞菌(X. campestris pv campestris,简称Xcc)中,其转录调控系统还包括受Clp调控的两个转录因子TetR家族的FhrR和锌吸收调控蛋Zur (zinc uptake regulator).本研究目的在于阐明XXoc中,群体感应信号途径中类似于调控因子FhrR和Zur的两个基因fhrR、zur以及天冬酰胺合成酶基因(asparagine synthetase B,asnB)的生物学功能,以及利用实时荧光定量PCR的方法,分析这些基因在群体感系统中的调控地位。1.通过PCR扩增的方法从Rs105基因组中克隆到fhrR、zur基因,并证实二者在基因组中均为单拷贝。采用同源重组的方法,构建fhrR、zur的缺失突变体及其互补菌株。测定突变体及互补菌株的菌体形态、运动性、致病性和对过氧化氢的耐受性等多种表型;为进一步明确fhrR、zur两个调控因子在群体感应调控体系中的地位,利用实验室已有菌株(ΔrpfF和Δclp)构建过表达菌株,并通过实时荧光定量PCR (qRT-PCR)的方法探明fhrR、zur在各菌株转录表达水平。与野生型菌株相比,fhrR、zur缺失突变体的生长能力并未受到明显影响,但其运动性以及对葡萄糖的趋化应答反应有明显降低;fhrR缺失突变体的致病性升高,而zur基因的缺失则引起致病性显著降低,qRT-PCR结果表明fhrR、zur基因的缺失对目前已报道的致病相关基因的转录表达有一定影响。qRT-PCR结果显示,fhrR、zur基因在△clp中转录水平明显降低,这表明,fhrR、zur受全局性调控因子Clp正向调控,由此可推断,群体感应系统通过调控fhrR、zur基因表达,从而影响细菌性条斑病菌的致病性等表型。2.通过PCR扩增的方法从Rs105基因组中克隆到asnB基因,并证实该基因在基因组中为单拷贝。采用同源重组的方法,构建asnB的缺失突变体及其互补菌株,测定突变体及互补菌株的菌体形态、运动性、致病性及过敏性反应等表型,证明asnB基因的缺失使条斑病菌丧失致病性,并且严重影响病菌对不同氮源的吸收能力(见殷芳群毕业论文)。本文为进一步阐明asnB基因的生理功能及致病机制,通过多种表型测定以及实时荧光定量PCR的方法对其进行了研究。结果表明asnB与Xoc对过氧化氢的耐受性有直接联系,qRT-PCR结果显示,在asnB缺失突变体中,抗氧化相关基因和致病相关基因的转录表达量都较野生型显著降低,推测asnB可能通过影响病菌对氧迸发的耐受性而影响其致病性;asnB基因在ΔrpfF和Δclp中转录水平明显降低,这表明,asnB受DSF和全局调控因子Clp正向调控;另一方面,通过比对发现Xoc基因组中xoc2999(asnB2)亦编码天冬酰胺合成酶,且该基因在黄单胞菌属中高度保守,并与asnB有33%同源性。采用同源重组的方法构建asnB2的缺失突变体,研究表明,asnB2与asnB在功能上并没有统一性,而且asnB2的表达也与asnB没有相关性。
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