配股是我国市场经济和股票市场实现资源优化配置的重要方式，以其存在的合理性成为我国证券市场中盛行的再融资方式。虽然自1998年允许上市公司实行增发新股进行股权再融资后，增发融资发展势头强劲，但是配股作为一项相对成熟的融资手段，已经被上市公司、市场和投资者广泛接受，并在以后相当长的时间内，仍是我国上市公司进行股权再融资的重要方式之一，但是配股也存在许多问题。本文从理论和实证两个方面就配股对股东利益的影响进行了深入研究。 在资本市场有效性的假设条件下，二元股权结构下同时存在流通股和非流通股，二者的利益实现方式是不同的。非流通股股东的利益主要是通过股票的溢价发行、净资产增值和盈利分红来实现的。对于流通股股东而言，由于其股份可以在二级市场上随时变现流通，股利和股价的波动对其利益有重要影响，因此，他们更重视上市公司的可持续发展能力以及上市公司价值的持续提升。上市公司配股行为将使得那些部分或全部放弃配股的非流通股股东财富增加，而流通股股东不参加配股其财富就会减少，而新增股东的财富一般都会增加。因此，非流通股股东为使其财富增值最大，倾向于放弃配股，中小股东会最大限度参与配股。在一元股权结构下，由于不存在非流通股与流通股的区别，股东为了使自己的利益不受到损害，就会努力参与配股。随后本文对二元股权结构下，流通股股东不同的配股行为引起的配股前后财富的变化进行实证分析，得出这样的结论：不参与配股的流通股股东短期内会有损失而尽量多参与配股的流通股股东就能获得收益，成为新股东的证券公司就能获得大量收益，但是流通股股东(不管新旧股东)的长期利益都是受到损害的。 同时本文还论述了我国配股的相关制度，为理论实证分析奠定制度背景，也为后面的对策建议奠定理论基础。最后笔者结合理论实证分析结果，向有关的监督部门、上市公司和投资者提出一些的建议。