大肠杆菌中硫氰酸酶结构和动力学性质的核磁共振研究

来源 :北京大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fly57384
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
硫氰酸酶广泛存在于细菌,古细菌和真核生物等各类生物体中,可能参与如氰酸根解毒、硫和硒的代谢以及铁硫蛋白质的合成和修复等重要的生物过程。在这些可能参与的生物过程中,它们通过硫氰酸酶结构域以过硫化物或过硒化物的形式充当硫或硒的载体,从而满足这些生物过程对硫或硒的需求。因此,对硫氰酸酶过硫化物或过硒化物的研究是了解硫氰酸酶家族生物功能的第一步,而过硫化物或过硒化物形成的分子机理又是对它们进行研究的前提。目前,硫氰酸酶过硫化物形成的分子机理并不清楚,对其分子水平的研究也不多,而对其分子动力学性质的研究则是空白。在体外实验中,典型的硫氰酸酶过硫化物可以通过其与底物硫代硫酸根的反应得到。为了更清楚地了解硫氰酸酶过硫化物形成的分子机理,本论文主要运用核磁共振技术,对大肠杆菌中三个单结构域的硫氰酸酶PspE、YgaP(1-107)和GlpE的结构、动力学性质以及与底物硫代硫酸根的反应进行了研究。此外,为了更多了解硫氰酸酶过硫化物的性质,我通过反应得到PspE过硫化物中间体,对其结构和动力学性质进行了研究。主要研究结果如下:  1.运用NMR滴定实验研究了PspE、YgaP(1-107)和GlpE及其突变体与底物硫代硫酸根的相互作用。结果表明,虽然它们与底物硫代硫酸根的结合位点均位于活性位点及附近区域,但它们与底物硫代硫酸根的相互作用具有多样性。它们与底物的结合方式不尽相同,并且活性位点区正电性氨基酸残基对它们与底物相互作用的影响也不相同。  2.运用核磁共振技术解析了PspE、YgaP(1-107)和GlpE的溶液结构。三个蛋白质的整体结构相似,均是由中心β片和两侧的α螺旋所构成的典型的α/β硫氰酸酶结构域的结构。以Cys残基为活性中心的活性位点区形成保守的半环结构,这种半环结构对硫氰酸酶的催化过程具有至关重要的作用。另一方面,它们结构也存在不同之处,首先,PspE具有更短的序列和更少的二级结构,是结构最为紧凑的硫氰酸酶;其次,三者活性区的凹槽形状略有不同,并且活性位点以及附近区域的表面电性具有较大差别。这些结构上的差异是导致它们与底物的相互作用方式不同的重要原因。  3.应用核磁共振技术对PspE、YgaP(1-107)和GlpE的主链动力学性质进行了研究。三者的分子运动性质存在许多相同之处,特别是活性位点区的运动性质。三个蛋白质分子活性位点区的大部分氨基酸残基在微秒到毫秒时间尺度上存在构象交换,这对它们参与催化反应具有重要的意义。  4.应用核磁共振技术对PspE过硫化物中间体的溶液结构和主链动力学性质进行了研究。PspE过硫化物中间体与还原态PspE的结构非常相似,但是PspE过硫化物中间体分子的动力学性质与PspE具有较大的差别。在过硫化物中间体分子中,无论是具有构象交换的氨基酸残基的数目还是构象交换的速率都有明显的增加,特别是活性位点及其附近区域。这种运动性质的改变有利于PspE过硫化物中间体进一步参与下游的反应,为所参与的生物过程提供所需硫原子。  5.基于上述研究结果,对硫氰酸酶反应生成过硫化物中间体的分子机理进行了探讨。硫氰酸酶活性区的结构和构象交换是其参与催化反应的基础。而活性区及附近的正电性残基对反应有着重要影响,这些影响与正电性残基所处的位置,结构和动力学性质等相关。
其他文献
夏日炎炎,我们在出门前会涂上防晒霜,穿上防晒衣,防止皮肤晒黑、晒伤。那么我们每天餐桌上的蔬菜在生长过程中是如何逃避这烈日的?让果菜团队的专家给您讲讲大棚是如何降温的
学位
——01——  二十多年前,妻在台北妇幼医院生产。  大概因为是头胎,痛了一天一夜还生不出。那时的产房不准丈夫进去帮忙,我只好心急如焚地在门外走来走去。  里面传出的每一声呻吟,都揪在自己的心上。总算子宫口渐渐张开。  “开六指了。”护士小姐出来说。  “开八指了。”医师匆匆忙忙走进去。  “看到头发了。”护士探出头来笑笑。  才说不久,我就听到娃娃的哭声。  转眼,儿子已经二十五岁,年轻人常改变
期刊
本论文采用水热法和微波水热法合成了三氧化钼纳米带及高分子聚合物聚苯胺、聚吡咯和聚3,4-乙烯二氧噻吩插层的五氧化二钒及三氧化钼层状复合材料;研究了不同反应条件对所得产
议论文是议论说理的文章,是以议论为主要表达方式的一种文体,它主要通过摆事实,讲道理,运用事实材料、逻辑推理来阐发作者的观点,表明赞成什么,反对什么。教读议论文时,抓住议论文中论点、论据和论证这三要素是有必要的,是合理的。但是如果议论文教学仅仅停留于此,那就失去了议论文教学的意义。在初中语文议论文的教学过程中,抓住文本特点、明确教学要求、深化学生体验是课堂教学效率的重要保障。本文结合实例谈谈如何搞好
如果没有看见清洁工,我也许不会踏入某个画廊,更不会走进展室,穿过开幕酒会的人群.清洁工在用笤帚清扫过地面后,仔细地重复着一个步骤——以毫厘不差的频率移动着色彩艳丽的
请下载后查看,本文暂不支持在线获取查看简介。 Please download to view, this article does not support online access to view profile.
期刊
请下载后查看,本文暂不支持在线获取查看简介。 Please download to view, this article does not support online access to view profile.
期刊
很多人都知道他设计了东风双飞燕徽标,但并非所有人都很清楚,他如何从最初的单飞燕构想向双飞燕切换的详细过程。本期口述历史,我们邀请73岁的老东风人艾德昆还原这段尘封往
空旷骨架材料自上个世纪五十年代以来发展迅猛;从传统的硅铝酸盐,(亚)磷酸盐,发展到锗酸盐,MOF材料等等。它们在气体吸附、工业催化、离子交换等领域发挥着不可替代的作用。目