全球气候变化引发人们对低碳经济与低碳创新发展的空前重视,向低碳经济转型成为各国区域经济发展的新趋势。区域创新系统是区域经济可持续发展的驱动力。目前,我国现有的区域创新系统存在低碳特征不明显、合作层次低、动力不足、利益分配机制低效等缺憾,改革已刻不容缓。因此,有必要将当前的低碳经济需求纳入到区域创新系统中,基于区域低碳创新系统,研究产学研的协同创新问题。本论文尝试从产学研合作、区域创新系统、低碳经济三者之间的内在关联入手,借助系统学理论及系统动力学模型研究以下核心问题:区域低碳创新系统的结构及功能,基于区域低碳创新系统的产学研协同及核心影响因素。本文首先系统梳理与选题相关的低碳经济、区域创新系统、产学研合作、协同创新等研究成果,分析区域低碳技术创新和低碳制度创新的条件及动因。然后,对区域低碳创新系统的内涵和结构进行分析,并深入探讨区域低碳创新系统和产学研合作之间的内在关联。接着,选取两个国际典型区域低碳创新系统进行案例分析,总结出其产学研协同创新的经验及影响因素。最后,构建基于区域低碳创新系统的产学研协同静态模型和动态模型,并在此基础上以江苏省为例进行实证分析,最后根据对改变政府、企业对高校和学研机构资金的分配比例得到的不同模拟结果,建议无论是政府还是企业均应该加大对学研的投入,同时政府精简部门人员提高政府工作能力,增加产学研效率,促进区域经济的发展。而且改变企业对高校和科研机构的投入对GDP、高新技术产值都有显著的提高,尤其是在二氧化碳排放方面有更为显著的效果。