【摘 要】
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人类染色体蛋白质组计划(C-HPP)旨在鉴定人类每条染色体上的编码基因翻译的蛋白质。人类基因组注释约2万个编码基因中约有16520个找到了相应的蛋白证据,然而目前还剩下20%编
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人类染色体蛋白质组计划(C-HPP)旨在鉴定人类每条染色体上的编码基因翻译的蛋白质。人类基因组注释约2万个编码基因中约有16520个找到了相应的蛋白证据,然而目前还剩下20%编码基因尚未找到其蛋白质实验证据,称为“漏检蛋白质”。表观遗传调控导致的基因选择性转录是造成蛋白质“漏检”的主要原因之一。因此,我们试图通过表观遗传调控机制干预成人细胞以刺激沉默的基因再次表达,从而提高“漏检蛋白质”鉴定机率,为完善人类蛋白质全图谱奠定基础。目的:构建表观遗传调控机制干预细胞组蛋白的研究方法,严格筛选并鉴定“漏检蛋白质”。方法:本研究利用表观遗传药物分别干预A549、MHCC97H、HCT116,建立体外表观遗传调节模型,首先确定药物有效作用浓度;进一步运用非标定量质谱进行蛋白质组学鉴定“漏检蛋白质”,结合测序结果;接着运用生物统计学软件对鉴定的“漏检蛋白质”进行染色体定位,理化性质以及功能分析。结果:表观遗传药物干预细胞能全局地开放基因表达,结果显示未呈现染色体富集性,并筛选出27个PE2-4和5个PE5高可信度的“漏检蛋白质”。生物信息学分析证明“漏检蛋白质”的理化性质无明显特征。
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