新铁炮百合RAPD反应体系及自交初代遗传分化研究

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新铁炮百合(Lilium formolongi)是台湾百合(L.formosanum)和麝香百合(L.Longiflorum)种间杂种,是以种子繁殖生产切花为特色。其株系间亲和性较大,又可保留种球,适合研究世代的遗传分化。本实验通过对自交株系的RAPD检测,探讨了其遗传多样性变异趋势和株系间的遗传分化。主要研究结果如下: (1)通过优化设计,确定了新铁炮百合的RAPD反应体系和反应程序参数。 单引物反应:dNTPs 150μmol/L,Bg2+1.5mmol/L,Taq聚合酶1U,引物primer 0.3μmol/L,模板DNA50ng,反应总体积为20μl。 双引物反应:dNTPs 200μmol/L,Mg2+2mmol/L,Taq聚合酶1.5U,引物primer 0.4μmol/L,模板DNA50ng,反应总体积为20μl。双引物的最佳反应成分浓度普遍比单引物的要高。 反应程序参数:(1)94℃预变性5min 1个循环;(2)94℃变性30sec,37℃退火50sec,72℃延伸1min,35个循环;(3)72℃延伸10min 1个循环;(4)4℃保存,待用。 (2)采用正交设计的极差法得出影响RAPD实验因素的大小顺序:①反应条件因素显著性程度依次为:Mg2+>primer>Taq>dNTPs>DNA;②反应参数因素显著性程度依次为:循环次数>延伸时间>复性温度>复性时间。 门门 条单引物和 8个双引物用于新铁炮百合的 RAPD扩增,产生扩增总谱带达 198条,163条谱带是多态的,多态百分比达 引.8兄 双引物谱带的产生和单引物的谱带无必然关系。双引物可以扩增出单引物所没有的DNA片段,但也可能会连单引物的谱带也扩增不出来。 (4)用多态性百分率、相对多态性频度和 Shannon 遗传多样性指数评价世代间的遗传多样性变化。其中引物 SIg、5303+S 366\519+5210、5469+519、555+530白 多态百分比 均为 100儿 羡现极高的多态性。F。世代、F。世代、F。世代多态性百分比分别为 5 9.1趴 5 6.6兄 4 8.0队 多态性百分比呈现出下* 白 趋势。 三个世代的 遗传多样性主 数分别为:1.749、1.530、1.292,也是呈现下降的趋势。在总变异中,群体内和群体间遗传多样性所占的比率分别为 76.2%和 23.8儿羡现出群体内大于群体间的趋势,这与新铁炮百合的繁育系统相符合的。 门)通过非加权算术平均数对群聚类法 uPGMA)构建品系间的系统聚类树。从三个数据集获得的聚类结果可以看出,其聚类树状图基本反应系谱关系:双引物扩增结果能较精确反应其系谱关系。在亲缘关系相近的品系,用RAPD方法能比较准确地推测到世代间的遗传多样性、遗传分化的细小变化。
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