人类粪便样本中主要包括人体内源性代谢物,肠道菌群代谢物及其他化合物。对于粪便代谢组的分析不仅可以为发现疾病生物标志提供代谢信息,同时也可以为分析肠道菌群及人类健康间的关系提供新的切入点。在本研究中,我们使用化学同位素标记高效液相色谱-质谱(HPLC-MS)的方法完整并定量地分析了人类粪便样本中含胺及酚的代谢物,并利用13C2/12C2-丹璜酰区分标记胺和酚以提高色谱分析效率及质谱检测灵敏度。在本研究中,水,甲醇和乙腈被用作提取溶剂,而水→乙腈梯度提取表现出的最佳的提取效率。在定量研究中,我们使用梯度液相色谱-紫外及快速液相色谱-质谱检测对单个样本代谢组进行标准化。同时,明确单个样本总浓度有助于优化样本的最佳进样量,这样可以最大化液相色谱-质谱检测中可检测代谢物的数量,并避免分析柱过载。本研究首次利用简单的飞行时间质谱仪进行丹磺酰标记的液相色谱-质谱分析,说明利用低成本仪器进行化学同位素标记代谢组学分析是可行的。样本是从三个家庭中采集的粪便,并利用上述方法进行胺/酚亚代谢组成分分析。结果显示,30分钟的色谱-质谱分析平均能检测出1785个峰或推定代谢物,而243次色谱-质谱分析共检测出6200个峰。其中,67个峰通过将其分子质量及保留时间与丹磺酰标准库进行匹配而成功鉴定。此外,利用MyCompoundID所收录的数据,581个峰通过将其分子量与人类代谢组数据库进行匹配而推定,3197个峰通过将其分子量与循证代谢组数据库进行匹配而推定。对单个样本的定量代谢组分析显示其能够有效区分不同组别的样本,提示该方法可能用于之后的粪便代谢组研究中。