京海黄鸡ZP2基因启动子区甲基化对基因表达及产蛋数的影响分析

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京海黄鸡拥有小型、优质、早熟、抗逆性强四大特点。从生产记录中发现其群体中存在300日龄产蛋数高和低的特殊个体。产蛋数作为数量性状,其不仅易受环境的影响,同时受到微效多基因的控制。本文着眼于这两点,选择了可能对京海黄鸡产蛋数具有影响的4个基因(ZP2基因、Stat5b基因、AMH基因、MDH1基因),采用qRT-PCR的方法研究了四个基因在300日龄京海黄鸡个体组织里的表达规律,重点剖析了卵巢组织里的表达状况,并通过双荧光素酶基因报告系统对ZP2基因核心启动子区域进行了研究,本文还采用BSP(Bisulfite Sequencing PCR)测序的方法,对卵巢组织中ZP2基因启动子区CpG岛的甲基化进行了定量检测,同时分析了重要甲基化位点对基因mRNA表达量的调控作用,结合启动子区潜在的转录因子结合位点的预测,分析甲基化位点所在区域,进一步探讨ZP2基因的分子调控机制。主要实验结果如下:1.通过实时荧光定量检测4个基因在300日龄京海黄鸡9个组织中的mRNA的表达量发现,ZP2基因在卵巢中的表达丰度最高,其次是肾脏;Stat5b基因在腿肌中的表达丰度最高,其次是胸肌,在卵巢中的表达量较低;AMH基因在卵巢中的表达丰度最高,其它组织中的表达量较低;MDH1基因在心脏中的表达丰度最高,其次是腿肌,在卵巢中表达量较低。ZP2基因在高产组中的表达量极显著高于低产组(P<0.01),Stat5b基因和AMH基因在高产组的表达量低于低产组,但没有明显差异,MDH1基因在两组间的表达量几乎相同。以上结果说明,ZP2基因表达上调对京海黄鸡的产蛋数有一定影响,Stat5b基因和MDH1基因对京海黄鸡的产蛋数可能没有直接影响,AMH基因在卵巢中具有较高的表达量,但高低产组的表达差异不显著,其在京海黄鸡卵巢中发挥的作用还需进一步研究。2.京海黄鸡ZP2基因启动子系列缺失片段在DF-1细胞中具有不同的启动子活性,重组质粒pGL3-P6的活性最高,pGL3-P5的活性明显下降,说明ZP2基因启动子的核心区域在-1552~-1348之间,与Neural Network Promoter Predietion在线网站预测的结果一致。3.通过软件预测发现ZP2基因启动子区共有4个CpG岛,利用BSP技术检测启动子区CpG岛的甲基化状态。ZP2-1扩增片段总体甲基化程度与mRNA表达量有一定程度的负相关(R=-0.197,P=0.672),所有单个位点的甲基化程度与mRNA表达量的相关性都没有达到显著水平;ZP2-2扩增片段总体的甲基化程度与mRNA的表达量也有一定程度的负相关(R=-0.264,P=0.567),其中mC-9位点的甲基化程度与mRNA存在极显著的负相关(P<0.01),但其并没有位于转录因子结合位点内,mC-20和mC-21位点的甲基化程度与mRNA存在显著的负相关(P<0.05),且都位于Sp1转录因子结合位点上,推测上述位点可能是调控转录的主要位点,且可能通过抑制Sp1和DNA的结合,从而抑制ZP2基因的转录。
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