允许和鼓励外资并购国内上市公司是我国推进资本市场发展、调整企业经济结构和促进经济发展的重要举措。通过对并购与公司治理关系、国内外公司治理结构评价指标体系分析,本文提出外资并购对上市公司治理结构的影响路径,即股权结构、董事会、监事会、股东大会、高管层以及信息披露六个层面。本文以我国沪、深两市在1999-2005年度内发生外资并购的48家上市公司为样本,从影响路径的六个层面中选取13个指标,定量研究外资并购对我国上市公司治理结构的影响。单项指标均值分析结果表明：外资并购整体上对改善我国上市公司治理结构发挥了积极作用。通过因子分析法将13个指标计算出一个综合得分,发现并购前后样本公司综合得分均值之间不存在显著差异,外资并购对我国上市公司治理水平改善不显著。不同外资并购模式下,我国上市公司治理结构得到优化的比例呈现较大差异：外资直接并购模式引发我国上市公司治理结构改善的效果要优于间接并购模式；公司治理结构得到优化的上市公司中,90%以上来自于制造业,其中以化学、塑胶塑料类公司治理结构得到优化的比例最高。