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目的:对秦岭地区的北柴胡样品进行遗传多样性分析,建立北柴胡药材质量评价方法,筛选出秦岭地区优质北柴胡产地。方法:使用CTAB法提取北柴胡样品基因组总DNA,采用通用引物mat K,进行PCR扩增,对PCR产物进行测序,对不同产地北柴胡的遗传多样性进行分析;采用UPLC法,乙腈-0.1%磷酸水为流动相进行梯度洗脱,检测波长210 nm,柱温30℃,体积流速0.2 m L?min-1,测定不同产地样品柴胡皂苷类成分的含量,分析不同产地北柴胡样品皂苷含量的差异性及变化趋势;采用UPLC法,乙腈-0.1%磷酸水为流动相梯度洗脱,检测波长210 nm,柱温30℃,体积流速0.2m L?min-1,建立不同产地北柴胡醇溶性指纹图谱,采用SPSS 23.0及SIMCA 14.1软件对样品数据进行聚类分析及主成分分析;采用UPLC法,乙腈-0.1%磷酸水为流动相梯度洗脱,检测波长254 nm,柱温30℃,体积流速0.2 m L?min-1,建立不同产地北柴胡水溶性指纹图谱,通过聚类分析及主成分分析对数据进行分析。结果:北柴胡mat K序列长度为508 bp,34个样本分为8个单倍型,碱基突变率为1.57%,进化树聚类结果,部分甘肃省产北柴胡栽培品与野生品可聚为一类,陕西省及山西省产北柴胡部分栽培品与甘肃省产北柴胡样品聚为一类;皂苷类成分含量研究显示甘肃产北柴胡药材(2年生以上)3种柴胡皂苷含量高于平均值9.8705 mg?g-1,陕西产北柴胡皂苷含量接近均值,而山西产北柴胡皂苷含量低于均值,且具有较大的波动性;在建立的不同产地的北柴胡药材醇溶性指纹图谱中,标定出14个共有峰,样品相似度分析,除S17外,其余样品相似度均高于0.902,聚类分析显示,甘肃产北柴胡药材聚类较集中,主成分分析提取出4种主成分,分别为5号峰SSa,8号峰SSd及两种未知成分10号峰与14号峰。在建立的不同产地北柴胡水溶性指纹图谱中,标定出18个共有峰,样品相似度分析显示,除S17外,其余样品相似度均高于0.905,聚类分析显示,3个省份北柴胡样品,山西省产样品聚类较分散,甘肃省产样品聚类距离较近,主成分分析提取出5种主成分,为11号峰SSb2及4种未知化合物,其中3种分别对应5号峰、13号峰、16号峰。结论:通过对秦岭地区不同产地北柴胡遗传多样性分析,发现不同产地北柴胡样品遗传距离较小,具有较近的亲缘关系,可认为北柴胡植物形态的差异性主要是生长环境的不同导致;通过对北柴胡样品皂苷类成分含量的研究、醇溶性指纹图谱及水溶性指纹图谱研究,发现秦岭地区北柴胡药材以甘肃省产药材皂苷类成分含量较高,质量较稳定,陕西产药材次之,而山西省产北柴胡药材皂苷类含量较低,波动性较大,质量差异性较大。