大鼠大脑皮层发育的小RNA转录组研究

来源 :中国科学院研究生院 中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhangmin6278
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大脑皮层的神经发育是一个非常复杂的过程,主要包括神经前体细胞的自我更新、分化、迁移和成熟等步骤:即室管膜区(Ventricularzone)产生的新生椎体神经元,需要以“从里至外”(inside-out)模式通过放射状迁移的方式逐渐向皮层表面迁移,最终到达目的地而形成非常精确定位的板层样结构。在这一过程中,基因表达调控是十分精密周全的,基因表达的异常可影响大脑皮层的正常发育并导致畸形的发生。miRNA是一类非编码小RNA分子,主要起转录后基因表达调节作用,并在多种生理和(或)病理状态下发挥重要作用。已有大量研究报道miRNA参与皮层发育,但所有miRNA在随皮层发育过程中表达模式系统性改变仍不清楚。本研究采用高通量测序手段在转录组水平研究大鼠不同发育时期(E10-P28)皮层中小RNA表达模式。结果鉴定出不同发育时期特异性miRNA表达谱,此外,还发现101个新的miRNA分子,进一步证实部分新的miRNA分子成熟依赖于Dicer。更有意思的是,发现在miRNA与靶基因结合的“seed sequence”有大量RNA编辑现象发生,总体而言出生后发生RNA编辑的比率大于胚胎时期,暗示其具有一定的特殊生物学意义。同时,被认为在生殖细胞中特异表达的piRNA也被检测到,其胚胎时期大脑皮层表达丰度高于出生后。综上所述,本研究揭示了皮质发育过程中microRNA的表达模式,对理解miRNA在大脑皮层发育和发育异常疾病中的作用提供宝贵的数据资源。  
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