abrol基因转录调控机制研究及小鼠abrol基因敲除载体的构建

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中国疾病预防控制中心发布的《2010年中国卫生统计提要》的统计数据显示,癌症已成为我国人民群众的第一大疾病杀手。对癌症的有效治疗源于对肿瘤发生发展的深层次认识。近些年的研究显示众多细胞生长调节基因的功能异常与肿瘤的发生发展有关,abrol便是潜在的基因之一。前期的研究显示ABRO1具有抑制结肠癌和肝癌细胞系生长的功能。  abrol基因的转录调控机制目前尚未见报道,对abrol基因转录调控机制的研究可以加深了解该基因的表达特性。另外,abrol基因敲除小鼠模型是体内整体水平研究abrol基因生理功能的有效工具,其前提条件为构建小鼠abrol基因敲除载体。本研究一方面通过分析abrol基因转录起始位点上游顺式作用元件及预测转录因子对abrol启动子的影响,初步揭示abrol基因的表达调控机制;另一方面拟构建abrol基因敲除载体,为建立abrol基因敲除小鼠模型提供前提条件。  在揭示abrol基因的表达调控机制中,首先运用5’RACE方法在成人肝马拉松cDNA文库中确定了abrol的转录起始位点。其次克隆了abrol转录起始位点上游约2 kb的DNA序列,并对其5’端依次进行了片段缺失,运用双荧光素酶报告基因系统分析了不同长度abrol启动子的转录活性,结合突变实验确定了abrol基因转录调控的关键顺式调控元件。采用生物信息学方法预测了该元件可能结合的转录因子,并对预测转录因子对abrol启动子活性的影响运用报告基因、Real-time PCR、Western-Blotting等方法进行了验证。  在构建abrol基因敲除载体中,首先制定了敲除abrol外显子1的敲除策略;其次依据NCBI/Ensemnle数据库中的abrol基因序列及其上游约5 kb的DNA序列,设计了两同源臂引物,运用PCR方法将两同源臂克隆至敲除载体骨架上,通过酶切、测序方法鉴定敲除载体是否构建成功;最后制定了abrol敲除ES细胞的Southern-Blotting方案。  研究发现abrol在成人肝中的转录起始位点位于起始密码子ATG上游13bp;abrol基因特异转录激活因子核心结合元件位于转录起始点上游-89~-60 bp内,其中,-68、-67、-66位点处三个连续的胞嘧啶碱基含有abrol基因特异转录激活因子的核心结合序列;转录因子YY1可以抑制abrol基因启动子的活性。另外,构建了小鼠abrol基因敲除载体,为建立abrol基因敲除小鼠动物模型提供了条件。
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